70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4568 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 182 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  38.2 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  32.58 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  36.21 
 
 		 149 aa  84.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  33.92 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  38.07 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  35.88 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  35.88 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  35.43 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  34.3 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  34.66 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  34.86 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  34.12 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  35.59 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  33.72 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  34.09 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  36 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  35.12 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  31.4 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  28.42 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  34.29 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  28.66 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  57.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  34.12 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  30.93 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  43.48 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  66.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  52.5 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  66.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  66.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  25.71 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  55 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  66.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  35.56 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  62.5 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  37.61 
 
 		 247 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  39.29 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  34.25 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  52.5 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  39.29 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  33.93 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 166 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  52.5 
 
 		 192 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  29.17 
 
 		 187 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 163 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  62.96 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  62.96 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  27.01 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  69.23 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  62.96 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  34.72 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  69.23 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  32.2 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  42.86 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0761  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  27.21 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0298843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  48.65 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>