More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2275 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 536 aa  660    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 544 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 544 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 544 aa  757    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 544 aa  663    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 539 aa  701    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 547 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  74.1 
 
 		 543 aa  775    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  72.54 
 
 		 544 aa  758    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 543 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  69.13 
 
 		 540 aa  723    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 538 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  72.54 
 
 		 544 aa  755    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 544 aa  757    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 544 aa  757    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 553 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 541 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  73.52 
 
 		 538 aa  765    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0924  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 542 aa  647    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00446655  unclonable  9.722580000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 540 aa  649    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 549 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.05 
 
 		 540 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.91 
 
 		 538 aa  676    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  65.14 
 
 		 542 aa  683    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 550 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 541 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 547 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000396118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 549 aa  641    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 547 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 547 aa  640    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 546 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  69.33 
 
 		 546 aa  714    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  61.26 
 
 		 549 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  72.54 
 
 		 544 aa  755    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 540 aa  686    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  72.32 
 
 		 541 aa  775    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 540 aa  642    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  73 
 
 		 539 aa  747    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 539 aa  698    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 536 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  68.46 
 
 		 548 aa  715    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 538 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  63.76 
 
 		 544 aa  658    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.97 
 
 		 540 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  74.16 
 
 		 539 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  62.86 
 
 		 540 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 540 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  71.24 
 
 		 538 aa  761    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 544 aa  759    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  75.71 
 
 		 541 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 542 aa  756    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  71.24 
 
 		 541 aa  754    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0860  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 543 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 547 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 539 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  69.32 
 
 		 544 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 544 aa  667    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 547 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61 
 
 		 553 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 545 aa  648    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.91 
 
 		 538 aa  676    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  59.39 
 
 		 542 aa  634    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.37 
 
 		 541 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 540 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  68.08 
 
 		 547 aa  706    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  67.16 
 
 		 539 aa  711    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  69.33 
 
 		 547 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  99.07 
 
 		 539 aa  1053    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  100 
 
 		 539 aa  1058    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  72.35 
 
 		 544 aa  758    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  60.85 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 542 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  72.73 
 
 		 544 aa  757    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  65.39 
 
 		 546 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.37 
 
 		 541 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  65.97 
 
 		 538 aa  684    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 540 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  66.22 
 
 		 542 aa  677    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  63.89 
 
 		 541 aa  684    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 543 aa  697    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  64.76 
 
 		 539 aa  691    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  69 
 
 		 539 aa  707    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  63.4 
 
 		 538 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  61.19 
 
 		 540 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 540 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 547 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  63.08 
 
 		 541 aa  659    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.15 
 
 		 539 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  60.65 
 
 		 548 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 554 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 547 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 548 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.04 
 
 		 541 aa  646    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 545 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.37 
 
 		 541 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  61.18 
 
 		 541 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  61.36 
 
 		 544 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>