More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4398 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 544 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  90.27 
 
 		 545 aa  931    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  83.92 
 
 		 541 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 539 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  67.55 
 
 		 547 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  82.45 
 
 		 547 aa  845    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  83.65 
 
 		 540 aa  864    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 540 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  66.17 
 
 		 544 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  80.67 
 
 		 541 aa  852    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  69.17 
 
 		 537 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  61.8 
 
 		 543 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  64.08 
 
 		 545 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 544 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.07 
 
 		 542 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  86.95 
 
 		 542 aa  897    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  66.17 
 
 		 544 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 538 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  692    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 544 aa  702    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  67.75 
 
 		 527 aa  691    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 541 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  82.84 
 
 		 541 aa  872    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  65.45 
 
 		 547 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.29 
 
 		 538 aa  664    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 546 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 541 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  66.17 
 
 		 544 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  64.69 
 
 		 538 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  65.19 
 
 		 539 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 535 aa  663    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  67.05 
 
 		 549 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.72 
 
 		 543 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  80.48 
 
 		 543 aa  848    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  65.24 
 
 		 539 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  66.29 
 
 		 536 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.42 
 
 		 542 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  70.91 
 
 		 544 aa  736    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.54 
 
 		 546 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  80.23 
 
 		 541 aa  839    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  100 
 
 		 540 aa  1052    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  68.51 
 
 		 541 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.74 
 
 		 538 aa  678    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  62.1 
 
 		 534 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.56 
 
 		 542 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  87.81 
 
 		 542 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  83.7 
 
 		 540 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  64.91 
 
 		 543 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  65.55 
 
 		 542 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 553 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.2 
 
 		 545 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  84.34 
 
 		 544 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  83.21 
 
 		 546 aa  846    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.12 
 
 		 550 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  82.84 
 
 		 541 aa  872    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.58 
 
 		 536 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  69.07 
 
 		 540 aa  710    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  84.38 
 
 		 541 aa  853    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 542 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  81.37 
 
 		 543 aa  852    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  60.78 
 
 		 539 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  60.97 
 
 		 539 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  82.45 
 
 		 542 aa  859    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.6 
 
 		 539 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.67 
 
 		 546 aa  672    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  92.96 
 
 		 540 aa  995    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 549 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  61.99 
 
 		 553 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  66.17 
 
 		 544 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 543 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  83.92 
 
 		 540 aa  880    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.47 
 
 		 539 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  84.53 
 
 		 545 aa  876    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  63.47 
 
 		 536 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 541 aa  678    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.73 
 
 		 548 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 542 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 547 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  86.3 
 
 		 539 aa  918    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  67.36 
 
 		 541 aa  714    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 538 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 540 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.74 
 
 		 538 aa  678    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.78 
 
 		 539 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  67.81 
 
 		 541 aa  718    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  83.55 
 
 		 541 aa  893    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  82.84 
 
 		 541 aa  872    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  83.39 
 
 		 541 aa  878    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 538 aa  643    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  73.25 
 
 		 540 aa  778    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  83.7 
 
 		 540 aa  888    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  83.21 
 
 		 541 aa  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  67.29 
 
 		 538 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64.71 
 
 		 546 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  85.71 
 
 		 541 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  69.22 
 
 		 540 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>