More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0633 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  65.51 
 
 		 542 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 541 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 544 aa  688    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  65.55 
 
 		 540 aa  678    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  67.28 
 
 		 538 aa  704    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 538 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  70.76 
 
 		 536 aa  745    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  66.03 
 
 		 540 aa  676    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 540 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 541 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  72.04 
 
 		 537 aa  762    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 540 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  67.3 
 
 		 540 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  66.42 
 
 		 534 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  68.34 
 
 		 536 aa  706    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  66.79 
 
 		 539 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  67.3 
 
 		 541 aa  675    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  65.01 
 
 		 543 aa  674    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  68.43 
 
 		 546 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 540 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  63.53 
 
 		 545 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  66.36 
 
 		 541 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 544 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  71.81 
 
 		 540 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  100 
 
 		 546 aa  1073    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 541 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  66.04 
 
 		 540 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  65.39 
 
 		 540 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  67.11 
 
 		 540 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  68.94 
 
 		 543 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64 
 
 		 546 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  68.59 
 
 		 541 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.21 
 
 		 542 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  67.11 
 
 		 541 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  65.34 
 
 		 547 aa  659    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 540 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 535 aa  689    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 541 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 542 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  63.17 
 
 		 541 aa  659    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  67.1 
 
 		 541 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 540 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  64.34 
 
 		 540 aa  652    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  74.24 
 
 		 540 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  72.92 
 
 		 541 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  68.97 
 
 		 527 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  64.11 
 
 		 539 aa  648    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  69.22 
 
 		 541 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.14 
 
 		 546 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  65.36 
 
 		 540 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  67.1 
 
 		 541 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  64.54 
 
 		 543 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 545 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  65.54 
 
 		 544 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  85.71 
 
 		 549 aa  857    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 545 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  67.97 
 
 		 536 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  67.17 
 
 		 544 aa  678    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  67.05 
 
 		 542 aa  678    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  69.13 
 
 		 545 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  68.45 
 
 		 539 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  68.76 
 
 		 541 aa  695    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  62.06 
 
 		 547 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  64.88 
 
 		 541 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  64.88 
 
 		 543 aa  670    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  63.06 
 
 		 538 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  70.83 
 
 		 541 aa  737    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  67.78 
 
 		 541 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  67.1 
 
 		 541 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 540 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  72.35 
 
 		 541 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  63.72 
 
 		 542 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  68.6 
 
 		 541 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  66.22 
 
 		 541 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  72.76 
 
 		 542 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 541 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  67.17 
 
 		 546 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  67.3 
 
 		 542 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  62.04 
 
 		 541 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 539 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 541 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  64.8 
 
 		 537 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  631  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 543 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 538 aa  631  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  59.03 
 
 		 539 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 536 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 547 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  64.72 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  60.63 
 
 		 541 aa  628  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 542 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 543 aa  628  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>