More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2175 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 544 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.5 
 
 		 544 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  79.28 
 
 		 540 aa  828    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  63.41 
 
 		 547 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 544 aa  697    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  80.15 
 
 		 540 aa  854    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.07 
 
 		 544 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  80.19 
 
 		 545 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  79.41 
 
 		 541 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  63.88 
 
 		 544 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.07 
 
 		 544 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.07 
 
 		 544 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  75.67 
 
 		 540 aa  776    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  79.11 
 
 		 541 aa  834    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  65.19 
 
 		 537 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  77.72 
 
 		 544 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.99 
 
 		 538 aa  670    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  65.03 
 
 		 547 aa  680    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  77.65 
 
 		 541 aa  786    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  63.14 
 
 		 536 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  64.13 
 
 		 539 aa  663    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 547 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  66.54 
 
 		 542 aa  698    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  76.52 
 
 		 540 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  59.6 
 
 		 543 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 538 aa  675    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  77.11 
 
 		 541 aa  803    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 538 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  76.8 
 
 		 541 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 546 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  63.93 
 
 		 540 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  78.24 
 
 		 540 aa  797    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  63.88 
 
 		 544 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.69 
 
 		 544 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  80.89 
 
 		 539 aa  858    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  66.54 
 
 		 540 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  64.34 
 
 		 541 aa  682    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  64.69 
 
 		 545 aa  680    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  65.07 
 
 		 541 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.78 
 
 		 539 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 536 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  63.6 
 
 		 541 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  78.31 
 
 		 543 aa  830    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  75.37 
 
 		 543 aa  780    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  100 
 
 		 541 aa  1059    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  78.93 
 
 		 540 aa  850    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 538 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.76 
 
 		 542 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 544 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.07 
 
 		 544 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  80.23 
 
 		 542 aa  824    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  63.4 
 
 		 542 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  76.06 
 
 		 541 aa  789    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  76.4 
 
 		 542 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.4 
 
 		 553 aa  649    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 545 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  79.09 
 
 		 540 aa  827    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  65.74 
 
 		 541 aa  687    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  67.04 
 
 		 541 aa  695    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 549 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  80.49 
 
 		 542 aa  823    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  76.8 
 
 		 541 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.97 
 
 		 540 aa  681    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 547 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 539 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  79.66 
 
 		 541 aa  793    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  63.88 
 
 		 546 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  71.22 
 
 		 540 aa  743    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  77.18 
 
 		 541 aa  827    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  78.9 
 
 		 541 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  78.5 
 
 		 542 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.07 
 
 		 546 aa  658    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  79.11 
 
 		 540 aa  851    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  64.27 
 
 		 549 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  75.65 
 
 		 540 aa  784    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 541 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.1 
 
 		 538 aa  669    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.07 
 
 		 544 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  65.32 
 
 		 540 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  77.53 
 
 		 545 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  77.21 
 
 		 543 aa  819    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.99 
 
 		 538 aa  670    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  65.15 
 
 		 527 aa  674    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  77.52 
 
 		 547 aa  778    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  78.14 
 
 		 546 aa  786    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 538 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.6 
 
 		 539 aa  656    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  81.7 
 
 		 539 aa  871    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  66.85 
 
 		 541 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 553 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  78.92 
 
 		 542 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 541 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 541 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  78.04 
 
 		 541 aa  839    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  76.8 
 
 		 541 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  77.66 
 
 		 541 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  75.99 
 
 		 544 aa  780    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  74.71 
 
 		 541 aa  770    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 539 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5367  chaperonin GroEL  59.18 
 
 		 538 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal  0.589855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>