More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0161 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  63.58 
 
 		 544 aa  677    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 544 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 546 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  64.12 
 
 		 545 aa  665    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 544 aa  645    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 539 aa  675    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 545 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  63.35 
 
 		 542 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 540 aa  705    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  70.11 
 
 		 544 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  70.31 
 
 		 544 aa  719    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  70.31 
 
 		 544 aa  719    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 550 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 546 aa  646    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 541 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  63.94 
 
 		 537 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 543 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 547 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  62.93 
 
 		 547 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  62.22 
 
 		 542 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 545 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 548 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  62.2 
 
 		 545 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 544 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  65.84 
 
 		 560 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 546 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 554 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 548 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  64.65 
 
 		 551 aa  656    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 547 aa  661    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 544 aa  651    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  64.69 
 
 		 547 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 544 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.14 
 
 		 546 aa  690    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 548 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  70.11 
 
 		 544 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 545 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 555 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.19 
 
 		 544 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  63.83 
 
 		 552 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.04 
 
 		 548 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  70.07 
 
 		 539 aa  748    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  70.8 
 
 		 536 aa  745    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 548 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 547 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 541 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  65.46 
 
 		 540 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 550 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  61.17 
 
 		 552 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 551 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 544 aa  673    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 550 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  62 
 
 		 540 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  62 
 
 		 540 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 550 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 547 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  61.93 
 
 		 546 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  61.76 
 
 		 549 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.64 
 
 		 553 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.24 
 
 		 545 aa  697    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.44 
 
 		 547 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 539 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 540 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  64.46 
 
 		 541 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.22 
 
 		 540 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  63.14 
 
 		 544 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  62.19 
 
 		 542 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 542 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  67.35 
 
 		 539 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  67.16 
 
 		 539 aa  711    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 547 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 561 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 544 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 553 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  68.11 
 
 		 546 aa  729    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 540 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  62.72 
 
 		 547 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  64.23 
 
 		 542 aa  678    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 541 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 543 aa  669    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 539 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 539 aa  688    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 545 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  61.75 
 
 		 536 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 540 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  65.21 
 
 		 543 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  64.46 
 
 		 542 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 539 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  62.79 
 
 		 541 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 554 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  63.84 
 
 		 547 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 545 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 545 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  63.41 
 
 		 541 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  63.55 
 
 		 541 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  64.46 
 
 		 541 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.63 
 
 		 541 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  64.72 
 
 		 547 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>