More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6115 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
547 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  63.58 
 
 
543 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  673    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
544 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.05 
 
 
542 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  59.16 
 
 
544 aa  638    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
539 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
545 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  81.9 
 
 
541 aa  824    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.94 
 
 
549 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  81.02 
 
 
543 aa  850    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
536 aa  639    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.67 
 
 
544 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  673    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
538 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  79.18 
 
 
541 aa  842    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  68.02 
 
 
537 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  673    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  80.81 
 
 
541 aa  850    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  64.74 
 
 
541 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  81.82 
 
 
540 aa  845    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  83.81 
 
 
542 aa  866    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
544 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.34 
 
 
550 aa  654    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  61.34 
 
 
538 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  80.07 
 
 
543 aa  848    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
543 aa  640    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
553 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  66.16 
 
 
527 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
547 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
546 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
543 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
538 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.67 
 
 
544 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  68.45 
 
 
540 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  81.78 
 
 
540 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
535 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.92 
 
 
544 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
547 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  64.62 
 
 
539 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  64.68 
 
 
539 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
536 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.04 
 
 
539 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  63.76 
 
 
538 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  65.68 
 
 
538 aa  699    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  79.13 
 
 
541 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  80.48 
 
 
540 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
542 aa  706    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  84.57 
 
 
540 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.15 
 
 
548 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
542 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.86 
 
 
542 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  84.76 
 
 
540 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.32 
 
 
553 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  66.67 
 
 
545 aa  695    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
548 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
539 aa  668    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  80.81 
 
 
541 aa  850    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.84 
 
 
540 aa  679    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  69.5 
 
 
541 aa  717    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
542 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  81.7 
 
 
544 aa  855    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
539 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  61.22 
 
 
539 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
538 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  71.11 
 
 
540 aa  759    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64.2 
 
 
546 aa  651    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  80.42 
 
 
542 aa  836    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  80.42 
 
 
541 aa  828    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  64.24 
 
 
546 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.37 
 
 
538 aa  677    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.08 
 
 
541 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  82.63 
 
 
545 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  65.9 
 
 
547 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  81.7 
 
 
546 aa  833    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  81.32 
 
 
542 aa  853    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  67.04 
 
 
538 aa  721    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  81.89 
 
 
545 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
536 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
547 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  82.48 
 
 
541 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  79.7 
 
 
541 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  82.56 
 
 
539 aa  872    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
541 aa  670    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
554 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
541 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  82.29 
 
 
541 aa  870    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  80.81 
 
 
541 aa  850    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  80.26 
 
 
541 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  64.49 
 
 
544 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
538 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  66.24 
 
 
539 aa  703    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
549 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  80 
 
 
540 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  78.87 
 
 
547 aa  810    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
541 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  69.01 
 
 
544 aa  725    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>