More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2892 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  65.03 
 
 
544 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
547 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  61.25 
 
 
544 aa  670    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  67.67 
 
 
539 aa  726    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.41 
 
 
545 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.37 
 
 
542 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
545 aa  638    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  70.11 
 
 
540 aa  743    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
545 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  74.06 
 
 
544 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  74.25 
 
 
544 aa  776    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  74.25 
 
 
544 aa  776    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
546 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
541 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  61.95 
 
 
537 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0472  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
549 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.7 
 
 
542 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.76 
 
 
545 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
548 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
544 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  100 
 
 
541 aa  1058    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
546 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  61.84 
 
 
547 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  63.95 
 
 
551 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  60.85 
 
 
545 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
547 aa  634    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
544 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
544 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
546 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.8 
 
 
548 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.51 
 
 
544 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  74.06 
 
 
544 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  60.85 
 
 
545 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  60.45 
 
 
555 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
544 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
545 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  61.21 
 
 
543 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  62.52 
 
 
548 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  70.39 
 
 
539 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  70.13 
 
 
536 aa  738    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
548 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  65.29 
 
 
547 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
541 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  65.18 
 
 
540 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
543 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
552 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.92 
 
 
544 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
550 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  64.29 
 
 
549 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0701  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
545 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.149625  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
545 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
540 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  60.83 
 
 
576 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
546 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
549 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
553 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
545 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
547 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
539 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  63.47 
 
 
541 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  63.47 
 
 
541 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  67.55 
 
 
540 aa  718    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62.76 
 
 
544 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.28 
 
 
542 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.6 
 
 
542 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  74.95 
 
 
539 aa  792    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  75.05 
 
 
539 aa  790    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  63.47 
 
 
541 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
544 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
545 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
545 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3660  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
545 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000280031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  68.89 
 
 
546 aa  737    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
546 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
540 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  67.62 
 
 
542 aa  696    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  65 
 
 
541 aa  719    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  66.97 
 
 
543 aa  719    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
539 aa  712    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  70.49 
 
 
539 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
545 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3708  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
545 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.889887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  64.77 
 
 
543 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  63.28 
 
 
542 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  61.88 
 
 
544 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.17 
 
 
539 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  61.25 
 
 
541 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
554 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.97 
 
 
547 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
545 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
545 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
541 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
541 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
545 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  63.47 
 
 
541 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  63.1 
 
 
541 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  63.83 
 
 
547 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  61.69 
 
 
549 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  72.83 
 
 
542 aa  753    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  64.22 
 
 
544 aa  653    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>