More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0409 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 549 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 549 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 544 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 544 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 536 aa  653    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  63.18 
 
 		 538 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  66.22 
 
 		 548 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  67.17 
 
 		 539 aa  726    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 550 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.23 
 
 		 542 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 540 aa  692    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  72.83 
 
 		 540 aa  774    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 544 aa  756    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  70.52 
 
 		 544 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  70.52 
 
 		 544 aa  758    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  70.15 
 
 		 544 aa  757    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  67.16 
 
 		 538 aa  734    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.65 
 
 		 540 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  61.05 
 
 		 545 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.49 
 
 		 547 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 542 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 546 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 539 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 554 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.87 
 
 		 549 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 547 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 546 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 547 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 544 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 546 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 544 aa  756    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.43 
 
 		 539 aa  692    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.82 
 
 		 542 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  67.1 
 
 		 547 aa  696    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.25 
 
 		 543 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  63.94 
 
 		 548 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 539 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 536 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 547 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 540 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 547 aa  634    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 547 aa  634    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 547 aa  642    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  59.37 
 
 		 542 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 544 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  61.24 
 
 		 545 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 546 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  67.16 
 
 		 538 aa  734    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  76.34 
 
 		 542 aa  808    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 544 aa  641    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 544 aa  758    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 543 aa  640    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  59.33 
 
 		 538 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  70.15 
 
 		 544 aa  756    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60 
 
 		 547 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 547 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 547 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  61.3 
 
 		 539 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.16 
 
 		 540 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.81 
 
 		 540 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 544 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.77 
 
 		 542 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 547 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 539 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 539 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 546 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 545 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.81 
 
 		 546 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 538 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.99 
 
 		 541 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.11 
 
 		 539 aa  652    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  72.8 
 
 		 542 aa  746    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  71.45 
 
 		 541 aa  791    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  100 
 
 		 543 aa  1081    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  76.85 
 
 		 539 aa  828    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  73.8 
 
 		 539 aa  766    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 550 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 548 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  65.98 
 
 		 543 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.34 
 
 		 539 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  70.63 
 
 		 539 aa  764    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 543 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 546 aa  636    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  59.33 
 
 		 538 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1034  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 545 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  70.3 
 
 		 538 aa  759    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  70.52 
 
 		 544 aa  758    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64.65 
 
 		 546 aa  677    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  70.41 
 
 		 538 aa  760    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  61.15 
 
 		 544 aa  649    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 550 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 541 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 544 aa  648    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  70.52 
 
 		 544 aa  758    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  61.54 
 
 		 541 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 542 aa  756    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 541 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 545 aa  634    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>