More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1211 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 548 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4612  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.562715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.89 
 
 		 544 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  63.04 
 
 		 546 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  61.76 
 
 		 542 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 547 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 545 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  61.18 
 
 		 542 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  63.3 
 
 		 541 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.27 
 
 		 545 aa  638    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 552 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  63.2 
 
 		 538 aa  658    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.11 
 
 		 544 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.3 
 
 		 544 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.3 
 
 		 544 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 547 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 545 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 549 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 541 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 537 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  100 
 
 		 543 aa  1071    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3869  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.749849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.85 
 
 		 542 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  61.78 
 
 		 544 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  69.02 
 
 		 546 aa  753    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 554 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  61.8 
 
 		 548 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.85 
 
 		 542 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.69 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0645  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 545 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.34 
 
 		 547 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 546 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.8 
 
 		 548 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.11 
 
 		 544 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.7 
 
 		 540 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 548 aa  634    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  65.68 
 
 		 539 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  64.03 
 
 		 536 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  61.78 
 
 		 544 aa  638    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 547 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  61.5 
 
 		 548 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  61.72 
 
 		 540 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  61.65 
 
 		 547 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  61.68 
 
 		 547 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4488  chaperonin GroEL  62.97 
 
 		 547 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0309413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0672  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 545 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  64.34 
 
 		 541 aa  691    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  81.73 
 
 		 547 aa  875    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 547 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 538 aa  674    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 552 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 546 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.43 
 
 		 553 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.93 
 
 		 545 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  63.04 
 
 		 546 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 547 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 539 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.69 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.8 
 
 		 540 aa  655    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 548 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.88 
 
 		 542 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  61.8 
 
 		 542 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 539 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 539 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 547 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 547 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.69 
 
 		 549 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 542 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.75 
 
 		 546 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.27 
 
 		 545 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0701  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 545 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.149625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 547 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 542 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.18 
 
 		 542 aa  675    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 543 aa  650    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 548 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 542 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3708  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 545 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.889887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  62.15 
 
 		 543 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 538 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.31 
 
 		 545 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 547 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.04 
 
 		 539 aa  651    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 545 aa  639    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 554 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 547 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.09 
 
 		 540 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 545 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.77 
 
 		 541 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 541 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  61.24 
 
 		 545 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.69 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  69.02 
 
 		 546 aa  757    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 539 aa  661    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 544 aa  675    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 547 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  98.53 
 
 		 544 aa  1055    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>