More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0440 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 549 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  71.03 
 
 		 542 aa  755    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 544 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 546 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  62.88 
 
 		 547 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  67.56 
 
 		 539 aa  728    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 545 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  62.87 
 
 		 542 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  67.03 
 
 		 538 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 545 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  82.26 
 
 		 540 aa  892    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 548 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 547 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  73.02 
 
 		 544 aa  784    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  73.21 
 
 		 544 aa  786    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  73.21 
 
 		 544 aa  786    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 546 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 549 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 549 aa  678    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.74 
 
 		 542 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 546 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  59.36 
 
 		 542 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 546 aa  634    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 548 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 545 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.43 
 
 		 554 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.68 
 
 		 543 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60 
 
 		 547 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 546 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  67.03 
 
 		 538 aa  729    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 546 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 546 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.77 
 
 		 548 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 548 aa  670    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  73.02 
 
 		 544 aa  784    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  59.36 
 
 		 547 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  58.13 
 
 		 536 aa  638    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 542 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  73.21 
 
 		 544 aa  786    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.32 
 
 		 547 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  63.09 
 
 		 539 aa  682    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.29 
 
 		 536 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.65 
 
 		 547 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  65.45 
 
 		 547 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 550 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  62.87 
 
 		 541 aa  662    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 544 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  60.9 
 
 		 547 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 551 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 544 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 539 aa  637    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 550 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  61.26 
 
 		 548 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 546 aa  644    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 545 aa  636    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  73.21 
 
 		 544 aa  786    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 546 aa  646    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 544 aa  698    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  72.83 
 
 		 544 aa  785    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.9 
 
 		 547 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  61.52 
 
 		 547 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 539 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 538 aa  639    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 550 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.58 
 
 		 540 aa  646    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  60.08 
 
 		 548 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 544 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 542 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 545 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  65.13 
 
 		 539 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.94 
 
 		 539 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  62.27 
 
 		 540 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 547 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 541 aa  677    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  67.62 
 
 		 541 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.49 
 
 		 546 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 542 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  62.88 
 
 		 547 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  100 
 
 		 542 aa  1073    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  69.12 
 
 		 541 aa  751    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  71.88 
 
 		 543 aa  761    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  73.25 
 
 		 539 aa  785    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  80.97 
 
 		 539 aa  862    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 544 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 547 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  73.21 
 
 		 542 aa  785    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  61.39 
 
 		 548 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 546 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  62.14 
 
 		 547 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  73.02 
 
 		 544 aa  785    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 549 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.11 
 
 		 554 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  59.4 
 
 		 540 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 545 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 545 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.62 
 
 		 541 aa  648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 540 aa  658    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  73.02 
 
 		 544 aa  786    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 546 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>