More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0252 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
548 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
548 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
544 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  63.71 
 
 
546 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
545 aa  650    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.59 
 
 
544 aa  654    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  74.95 
 
 
539 aa  797    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
545 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  62.62 
 
 
542 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
547 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0289  chaperonin family protein  98.59 
 
 
373 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179412  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
545 aa  673    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  74.26 
 
 
540 aa  800    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
545 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  97.93 
 
 
544 aa  1017    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  98.12 
 
 
544 aa  1019    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  98.12 
 
 
544 aa  1019    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
550 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
546 aa  655    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  64.52 
 
 
541 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
547 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  63.01 
 
 
542 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
545 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  63.53 
 
 
548 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
560 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  63.96 
 
 
554 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  64.12 
 
 
551 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
546 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  65.13 
 
 
547 aa  656    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.14 
 
 
546 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  63.28 
 
 
548 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  97.93 
 
 
544 aa  1017    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  63.48 
 
 
555 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
544 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
552 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  63.15 
 
 
543 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  64.47 
 
 
548 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  67.66 
 
 
539 aa  721    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  68.7 
 
 
536 aa  719    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
546 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
546 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  64.84 
 
 
547 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
541 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  65.37 
 
 
540 aa  687    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  64.85 
 
 
550 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  63.96 
 
 
547 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  63.6 
 
 
547 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  63.35 
 
 
551 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.96 
 
 
544 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
550 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  63.09 
 
 
540 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
546 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  63.09 
 
 
540 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  63.05 
 
 
546 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  63.52 
 
 
546 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  65.79 
 
 
550 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
547 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
546 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
549 aa  653    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
546 aa  652    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.52 
 
 
553 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.01 
 
 
545 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  64.49 
 
 
539 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  64.94 
 
 
541 aa  691    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
540 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  62.41 
 
 
548 aa  660    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
544 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
542 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
542 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  71.96 
 
 
539 aa  761    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  71.96 
 
 
539 aa  759    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  63.83 
 
 
547 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
561 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
545 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
545 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  69.2 
 
 
546 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
551 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
546 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  62.95 
 
 
540 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  72.69 
 
 
542 aa  775    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  69.67 
 
 
541 aa  755    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  69.98 
 
 
543 aa  758    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  72.38 
 
 
539 aa  778    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  76.21 
 
 
539 aa  798    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  65.41 
 
 
545 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
546 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
543 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  63.3 
 
 
542 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  63.93 
 
 
551 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  63.26 
 
 
545 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
539 aa  691    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
545 aa  657    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.79 
 
 
554 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
547 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  66.05 
 
 
541 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  64.2 
 
 
545 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  64.94 
 
 
541 aa  691    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
541 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>