More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0253 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 548 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 545 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.62 
 
 		 544 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 542 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0472  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 549 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  71.32 
 
 		 539 aa  751    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62 
 
 		 545 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  61.61 
 
 		 542 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 549 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 545 aa  644    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  90.33 
 
 		 540 aa  966    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  76.04 
 
 		 544 aa  810    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  76.42 
 
 		 544 aa  810    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  76.42 
 
 		 544 aa  811    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  76.42 
 
 		 544 aa  811    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 545 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  60.76 
 
 		 546 aa  641    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 541 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 542 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  61.54 
 
 		 544 aa  643    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.98 
 
 		 545 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 548 aa  647    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.9 
 
 		 554 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0645  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 545 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 546 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  61.97 
 
 		 541 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0701  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 545 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.149625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2037  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 546 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.59 
 
 		 548 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  70.87 
 
 		 538 aa  753    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  76.42 
 
 		 544 aa  810    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0631  chaperonin GroEL  61.17 
 
 		 542 aa  644    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000011047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  62.06 
 
 		 555 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  70.43 
 
 		 542 aa  745    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 547 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.41 
 
 		 549 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.99 
 
 		 539 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 536 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 540 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.22 
 
 		 547 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  61.47 
 
 		 540 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 539 aa  653    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  70.97 
 
 		 541 aa  732    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  63.35 
 
 		 540 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.42 
 
 		 542 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.04 
 
 		 544 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 545 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 541 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 540 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 550 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.08 
 
 		 547 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  60.95 
 
 		 549 aa  642    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 545 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 553 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 545 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 542 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 541 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.02 
 
 		 540 aa  661    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 548 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 544 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.05 
 
 		 542 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 542 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  69 
 
 		 539 aa  722    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  69 
 
 		 539 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  61.17 
 
 		 545 aa  634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  61.17 
 
 		 545 aa  634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  76.6 
 
 		 542 aa  812    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.03 
 
 		 549 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.88 
 
 		 546 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 538 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.33 
 
 		 540 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3708  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 545 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.889887  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  81.57 
 
 		 542 aa  852    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  68.58 
 
 		 541 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  73.76 
 
 		 543 aa  779    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  73.65 
 
 		 539 aa  786    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  100 
 
 		 539 aa  1061    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 545 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 543 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  61.12 
 
 		 542 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 544 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 544 aa  652    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  63.53 
 
 		 539 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  61.44 
 
 		 541 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  61.24 
 
 		 538 aa  644    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 554 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 545 aa  645    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 548 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 548 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  63.15 
 
 		 541 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 545 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 541 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0672  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 545 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  70.87 
 
 		 538 aa  753    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  62.15 
 
 		 541 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 547 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  64.57 
 
 		 541 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 536 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>