More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0631 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 542 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 547 aa  656    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000396118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.26 
 
 		 544 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 546 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 548 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 545 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.92 
 
 		 542 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 547 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 546 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  77.11 
 
 		 545 aa  825    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 547 aa  657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1842  chaperonin GroEL  63.91 
 
 		 543 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.399369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  61.51 
 
 		 547 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  63.72 
 
 		 544 aa  653    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  59.29 
 
 		 544 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  59.29 
 
 		 544 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6727  chaperonin GroEL  60.64 
 
 		 540 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  74.48 
 
 		 544 aa  797    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 547 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  74.06 
 
 		 543 aa  786    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1805  chaperonin GroEL  63.14 
 
 		 550 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135763  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.39 
 
 		 547 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 546 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3117  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.222092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  76.92 
 
 		 545 aa  823    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0701  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 545 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.149625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 554 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 548 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 549 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 551 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 546 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2616  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 546 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 547 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 547 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 546 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 548 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  658    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2333  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0883149  normal  0.0155748 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0631  chaperonin GroEL  100 
 
 		 542 aa  1081    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000011047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 547 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 544 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  61.04 
 
 		 544 aa  649    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3997  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0864  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 546 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000144467  normal  0.0762282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  74.86 
 
 		 544 aa  795    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 546 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 548 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 547 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 545 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 547 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 547 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  61.58 
 
 		 549 aa  643    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 544 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.99 
 
 		 544 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  61.44 
 
 		 550 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 540 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 546 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 540 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 546 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.63 
 
 		 550 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2528  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 546 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0382557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 545 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  61.13 
 
 		 546 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0831  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00374886  decreased coverage  0.00000389435 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3153  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 553 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  61.47 
 
 		 545 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0750  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20211  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1518  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 547 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106639  normal  0.660636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2037  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 547 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  60.83 
 
 		 540 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 548 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  61.89 
 
 		 547 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.53 
 
 		 542 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  61.89 
 
 		 547 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3451  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1863  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00142  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 548 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  76.92 
 
 		 545 aa  824    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 550 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5271  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 546 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.641954  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0579  chaperonin GroEL  60.83 
 
 		 547 aa  641    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158784  normal  0.586113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 547 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 539 aa  641    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3522  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  60.83 
 
 		 540 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  61.8 
 
 		 548 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 547 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  64.17 
 
 		 549 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 544 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  75.38 
 
 		 545 aa  801    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>