More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0052 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 544 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 544 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 540 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 544 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  59.62 
 
 		 539 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 547 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 545 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 545 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 545 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 540 aa  661    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.34 
 
 		 549 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.87 
 
 		 544 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 544 aa  688    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 544 aa  688    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 545 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 541 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 537 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 547 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  66.42 
 
 		 541 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 542 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 545 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 548 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 544 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  61.54 
 
 		 560 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.46 
 
 		 554 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 547 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 541 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 546 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 548 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.87 
 
 		 544 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 536 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 543 aa  656    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 545 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 552 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 543 aa  635    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  60.56 
 
 		 548 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.04 
 
 		 539 aa  696    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 536 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 540 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.22 
 
 		 547 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 546 aa  644    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  61.78 
 
 		 540 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 550 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 546 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  58.36 
 
 		 538 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  61.24 
 
 		 552 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  63.12 
 
 		 548 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 547 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 540 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 540 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  59.56 
 
 		 546 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  58.36 
 
 		 538 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 550 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 546 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 553 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  64.33 
 
 		 545 aa  682    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 547 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  61.75 
 
 		 539 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 542 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 541 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  64.3 
 
 		 540 aa  687    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 544 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 544 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.05 
 
 		 542 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  63.26 
 
 		 549 aa  661    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 539 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 539 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  60.94 
 
 		 561 aa  634    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  63.64 
 
 		 544 aa  673    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 546 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 546 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  60.98 
 
 		 541 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 547 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  64.38 
 
 		 546 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 542 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 540 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.07 
 
 		 542 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.41 
 
 		 541 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  61.11 
 
 		 543 aa  652    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 539 aa  646    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 539 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  86.75 
 
 		 538 aa  932    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 547 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 543 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 542 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  65.05 
 
 		 542 aa  681    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 542 aa  648    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 539 aa  667    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 541 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  63.33 
 
 		 545 aa  652    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 554 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 545 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 545 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  89.8 
 
 		 538 aa  958    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 541 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 540 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 541 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 543 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  100 
 
 		 539 aa  1071    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>