More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0270 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06501  chaperonin GroEL  64.03 
 
 
564 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
544 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
540 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  59.47 
 
 
544 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  64.58 
 
 
541 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  63.03 
 
 
544 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  61.25 
 
 
540 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  58.49 
 
 
543 aa  643    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  59.96 
 
 
542 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
544 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
544 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
544 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
548 aa  634    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  64.58 
 
 
541 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  62.18 
 
 
539 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
543 aa  670    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1783  chaperonin GroEL  62.26 
 
 
560 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
544 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  63.6 
 
 
544 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  77 
 
 
555 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
545 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  65.03 
 
 
544 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  78.2 
 
 
560 aa  832    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
554 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
547 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  65.93 
 
 
542 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  62.85 
 
 
543 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  63.98 
 
 
544 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1747  chaperonin GroEL  61.85 
 
 
562 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0615  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
559 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  63.98 
 
 
544 aa  679    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
546 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  77 
 
 
555 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
544 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
545 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  69.79 
 
 
555 aa  751    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
544 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  77.34 
 
 
556 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.85 
 
 
539 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
536 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
547 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
544 aa  653    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
544 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  62.13 
 
 
542 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  62.27 
 
 
539 aa  672    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
538 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05061  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
563 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  62.09 
 
 
539 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  61.69 
 
 
541 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
538 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
547 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  65.41 
 
 
543 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
553 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
547 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  63.52 
 
 
543 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  61.11 
 
 
541 aa  636    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
547 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.63 
 
 
549 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  61.89 
 
 
544 aa  646    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  77.3 
 
 
576 aa  830    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  63.65 
 
 
545 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  100 
 
 
561 aa  1095    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  65.22 
 
 
544 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
538 aa  635    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.03 
 
 
546 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  63.26 
 
 
540 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
538 aa  664    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  63.65 
 
 
545 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
539 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04501  chaperonin GroEL  61.75 
 
 
565 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.383214  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  62.87 
 
 
542 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
547 aa  638    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.2 
 
 
539 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
544 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
541 aa  646    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  75.51 
 
 
553 aa  817    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
539 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  63.3 
 
 
545 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.76 
 
 
554 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  62.41 
 
 
538 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
544 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.07 
 
 
541 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
546 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  59.52 
 
 
540 aa  633  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  58.9 
 
 
547 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  59.09 
 
 
548 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.09 
 
 
547 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  58.3 
 
 
547 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  59.93 
 
 
540 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  58.78 
 
 
544 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
540 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
541 aa  631  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  59.17 
 
 
547 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
541 aa  628  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
542 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.59 
 
 
540 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.35 
 
 
550 aa  630  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>