More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2779 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  60.18 
 
 		 538 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  62.27 
 
 		 540 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  71.05 
 
 		 546 aa  754    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  59.56 
 
 		 539 aa  643    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 539 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  64.09 
 
 		 538 aa  681    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  100 
 
 		 546 aa  1092    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 542 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 544 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 544 aa  646    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  70.11 
 
 		 544 aa  755    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 542 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  60.65 
 
 		 547 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.32 
 
 		 547 aa  634    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.66 
 
 		 539 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 536 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  60.48 
 
 		 538 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  60.18 
 
 		 538 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  69.02 
 
 		 543 aa  753    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 539 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  59.44 
 
 		 544 aa  639    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  96.52 
 
 		 546 aa  1064    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  68.49 
 
 		 547 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 553 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 538 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.89 
 
 		 547 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 539 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  59.1 
 
 		 543 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  645    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  61.63 
 
 		 554 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 543 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 544 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.58 
 
 		 541 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0563  chaperonin GroEL  64.47 
 
 		 539 aa  682    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 544 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1055  chaperonin GroEL  85.71 
 
 		 545 aa  955    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 547 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 542 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 541 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 549 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 538 aa  631  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  58.38 
 
 		 543 aa  628  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  59.17 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.9 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 547 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  61.58 
 
 		 549 aa  625  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.73 
 
 		 547 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 546 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 544 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 547 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  59.45 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  60.83 
 
 		 550 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  58.35 
 
 		 544 aa  622  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 548 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  58.68 
 
 		 544 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0984  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 545 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488332  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 545 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  59.15 
 
 		 540 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  58.7 
 
 		 548 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  58.78 
 
 		 540 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0860  chaperonin GroEL  58.67 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 549 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 546 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0755  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 546 aa  621  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  59.62 
 
 		 548 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  59.04 
 
 		 542 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.68 
 
 		 554 aa  617  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000396118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 539 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  58.41 
 
 		 539 aa  615  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  59.4 
 
 		 545 aa  618  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5367  chaperonin GroEL  59.39 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  59.62 
 
 		 542 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 547 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.91 
 
 		 550 aa  615  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  56.76 
 
 		 548 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  60.93 
 
 		 547 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2734  chaperonin GroEL  59.32 
 
 		 543 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.657251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  58.41 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  58.21 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  58.87 
 
 		 542 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  59.67 
 
 		 542 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 548 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 546 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  56.62 
 
 		 543 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  56.91 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  58.87 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>