More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0204 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  62.88 
 
 
544 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  68.94 
 
 
544 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
546 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  65.52 
 
 
545 aa  686    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
544 aa  716    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
545 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  62.73 
 
 
542 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  60 
 
 
547 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
545 aa  661    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
540 aa  664    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
545 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  60.57 
 
 
547 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.73 
 
 
544 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.73 
 
 
544 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.73 
 
 
544 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
550 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0743  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
548 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0724  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
548 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
547 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
546 aa  679    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  61.22 
 
 
547 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  63.7 
 
 
542 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.88 
 
 
545 aa  670    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  61.75 
 
 
548 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
544 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  60.83 
 
 
560 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
546 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
554 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  61.7 
 
 
548 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  62.95 
 
 
547 aa  676    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  65.15 
 
 
551 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  67.55 
 
 
547 aa  715    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  67.55 
 
 
547 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  67.87 
 
 
546 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  64.35 
 
 
548 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.73 
 
 
544 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  61.84 
 
 
555 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
544 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
552 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
543 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  63.41 
 
 
548 aa  677    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.05 
 
 
539 aa  718    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
536 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
546 aa  651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
548 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  67.17 
 
 
547 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
550 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  62.15 
 
 
547 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.87 
 
 
546 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  61.13 
 
 
552 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  62.52 
 
 
547 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  62.13 
 
 
551 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  61.36 
 
 
550 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  61.01 
 
 
540 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  61.01 
 
 
540 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  63.57 
 
 
547 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  63.06 
 
 
550 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
547 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
545 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
546 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
549 aa  679    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.22 
 
 
553 aa  691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.69 
 
 
545 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
547 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  61.34 
 
 
547 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
539 aa  680    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
540 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.94 
 
 
540 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
548 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62.95 
 
 
544 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.75 
 
 
542 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
542 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
539 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  62.11 
 
 
539 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  61.02 
 
 
547 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  58.49 
 
 
561 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
544 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
545 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
545 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
553 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.62 
 
 
546 aa  682    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
551 aa  673    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
546 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  61.94 
 
 
540 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
547 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  61.23 
 
 
542 aa  647    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
543 aa  649    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
539 aa  650    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
540 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  65.28 
 
 
543 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  63.17 
 
 
542 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
551 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
545 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
545 aa  655    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  67.42 
 
 
554 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>