More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0860 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 548 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 548 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  63.84 
 
 		 544 aa  660    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.33 
 
 		 544 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 546 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 544 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 545 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  63.74 
 
 		 542 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 547 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 545 aa  649    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 546 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  60.65 
 
 		 545 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  60.49 
 
 		 547 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 545 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  62.19 
 
 		 545 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 550 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 547 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  59.62 
 
 		 546 aa  635    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0426  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 550 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000639435  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  62.85 
 
 		 547 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  62 
 
 		 547 aa  655    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  65.19 
 
 		 542 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  65.34 
 
 		 545 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 548 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 546 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2030  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.728979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.35 
 
 		 554 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 548 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  61.44 
 
 		 547 aa  653    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 551 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  64.2 
 
 		 546 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2616  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 547 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  63.77 
 
 		 547 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 546 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.66 
 
 		 548 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  59.7 
 
 		 544 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 552 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  64.13 
 
 		 543 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  64.49 
 
 		 548 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  64.81 
 
 		 539 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 536 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 546 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 548 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  64.54 
 
 		 547 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 550 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3234  chaperonin GroEL  66.67 
 
 		 547 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.554891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  63.14 
 
 		 547 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  62.81 
 
 		 552 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3172  chaperonin GroEL  65.72 
 
 		 547 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 551 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 544 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  63.95 
 
 		 550 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  61.12 
 
 		 540 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 546 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  61.12 
 
 		 540 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 546 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 546 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 545 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 547 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  62.89 
 
 		 550 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 545 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 546 aa  687    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3196  chaperonin GroEL  64.27 
 
 		 545 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 549 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 547 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 553 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 547 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  62.95 
 
 		 547 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  63.55 
 
 		 539 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 546 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 540 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  59.22 
 
 		 548 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 544 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.28 
 
 		 542 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 542 aa  667    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 539 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 539 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 547 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 545 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 545 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  59.01 
 
 		 553 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3660  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 545 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000280031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 551 aa  677    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 546 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5271  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.641954  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 540 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 547 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 546 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3522  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 546 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 540 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 543 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.89 
 
 		 542 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  62.92 
 
 		 551 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 545 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 545 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 554 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 547 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>