More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3679 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
547 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1428  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
537 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0053059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13480  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
546 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.434878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
546 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  60.79 
 
 
546 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
538 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
541 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
545 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.99 
 
 
542 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
541 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  60.55 
 
 
544 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  59.71 
 
 
540 aa  641    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1055  chaperonin GroEL  67.36 
 
 
545 aa  728    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.47 
 
 
544 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  63.25 
 
 
544 aa  673    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
543 aa  648    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1210  chaperonin GroEL (HSP60 family)  60.07 
 
 
537 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.44 
 
 
541 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0542  chaperonin GroEL  59.13 
 
 
551 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
547 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.44 
 
 
550 aa  634    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  60.4 
 
 
541 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.88 
 
 
554 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  61.02 
 
 
544 aa  639    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
549 aa  636    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
539 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
546 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  82.23 
 
 
546 aa  870    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
548 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  63.25 
 
 
544 aa  673    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
547 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  60.51 
 
 
540 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  100 
 
 
547 aa  1080    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
539 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
536 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
547 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
549 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
540 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
541 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
547 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  59.05 
 
 
544 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  61.84 
 
 
547 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  59.31 
 
 
540 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.87 
 
 
542 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
548 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
542 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1236  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
537 aa  636    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000227915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
548 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.75 
 
 
545 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  63.96 
 
 
546 aa  675    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0439  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
546 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000414877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  62.01 
 
 
539 aa  658    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  68.68 
 
 
546 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
541 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.12 
 
 
540 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
540 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.12 
 
 
542 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  59.27 
 
 
539 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  59.12 
 
 
539 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  81.57 
 
 
544 aa  890    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
539 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  59.25 
 
 
553 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
540 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  58.52 
 
 
546 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  62.3 
 
 
541 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.06 
 
 
544 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
547 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  60.81 
 
 
541 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.42 
 
 
541 aa  643    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  59.6 
 
 
543 aa  651    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  62.94 
 
 
539 aa  684    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0698  chaperonin GroEL  59.13 
 
 
551 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000118072  unclonable  0.000000000086232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  81.2 
 
 
543 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  63.22 
 
 
540 aa  669    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
538 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
547 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
539 aa  660    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  68.49 
 
 
546 aa  729    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4488  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
547 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0309413  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
541 aa  638    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0563  chaperonin GroEL  70.79 
 
 
539 aa  755    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
541 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
541 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
541 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.57 
 
 
538 aa  660    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
540 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
541 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  62.75 
 
 
538 aa  689    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
547 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  61.64 
 
 
545 aa  666    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
545 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
538 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
541 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  64.83 
 
 
538 aa  700    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>