More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1210 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1428  chaperonin GroEL  99.44 
 
 		 537 aa  1067    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0053059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1210  chaperonin GroEL (HSP60 family)  100 
 
 		 537 aa  1071    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  59.41 
 
 		 544 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1236  chaperonin GroEL  98.51 
 
 		 537 aa  1054    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000227915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0563  chaperonin GroEL  61.5 
 
 		 539 aa  643    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  59.4 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  59.48 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  59.4 
 
 		 544 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  59.4 
 
 		 544 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  59.43 
 
 		 544 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  59.02 
 
 		 542 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  59.02 
 
 		 544 aa  618  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  58.88 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.81 
 
 		 539 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  59.21 
 
 		 544 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  58.65 
 
 		 544 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 547 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  58.46 
 
 		 546 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 547 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  58.4 
 
 		 536 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  58.08 
 
 		 546 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  58.95 
 
 		 542 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 544 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  57.97 
 
 		 549 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  57.58 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  59.07 
 
 		 538 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1055  chaperonin GroEL  56.83 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  58.58 
 
 		 541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  57.38 
 
 		 539 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  57.77 
 
 		 542 aa  601  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  57.99 
 
 		 543 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  57.72 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  57.84 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  58.05 
 
 		 543 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  58.9 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  57.88 
 
 		 547 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  57.69 
 
 		 547 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  57.6 
 
 		 540 aa  594  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  57.06 
 
 		 540 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  57.12 
 
 		 548 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  58.16 
 
 		 546 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  57.17 
 
 		 547 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  57.17 
 
 		 547 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  56.74 
 
 		 554 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  57.06 
 
 		 527 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  56.07 
 
 		 548 aa  591  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  56.5 
 
 		 541 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  56.85 
 
 		 540 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  56.66 
 
 		 543 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  57.06 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  55.87 
 
 		 544 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  55.24 
 
 		 541 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  54.98 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  57.52 
 
 		 549 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  55.68 
 
 		 539 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  56.68 
 
 		 536 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  56.08 
 
 		 541 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  57.25 
 
 		 539 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  56.02 
 
 		 548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1565  chaperonin GroEL  57.77 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0194344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  56.3 
 
 		 536 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  55.77 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  55.68 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1470  chaperonin GroEL  57.97 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  56.42 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  57.79 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5367  chaperonin GroEL  55.68 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  56.24 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  57.41 
 
 		 547 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  54.85 
 
 		 540 aa  581  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  55.22 
 
 		 541 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  56.45 
 
 		 537 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  55.98 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  55.37 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  56.46 
 
 		 540 aa  579  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  56.42 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  56.98 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  55.79 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  55.49 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  56.12 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  56.93 
 
 		 543 aa  581  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  56.98 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  56 
 
 		 541 aa  579  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  57.31 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  56.84 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  58.51 
 
 		 546 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  54.85 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  56.57 
 
 		 547 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  55.6 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  55 
 
 		 545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  55.6 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  55.47 
 
 		 549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.901834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>