More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3702 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
541 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  84.47 
 
 
547 aa  856    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  80.53 
 
 
545 aa  819    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  64.41 
 
 
544 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  69.89 
 
 
544 aa  726    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  100 
 
 
540 aa  1049    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  90.76 
 
 
541 aa  953    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  84.04 
 
 
543 aa  880    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.78 
 
 
544 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  87.81 
 
 
542 aa  888    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.97 
 
 
544 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
544 aa  674    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
544 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  65 
 
 
539 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  78.52 
 
 
541 aa  817    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  67.82 
 
 
537 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
544 aa  674    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  89.65 
 
 
541 aa  937    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.22 
 
 
550 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  65.27 
 
 
547 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  66.6 
 
 
538 aa  677    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  63.74 
 
 
534 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  80.15 
 
 
542 aa  831    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  80.96 
 
 
540 aa  855    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  62.74 
 
 
538 aa  640    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.99 
 
 
539 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.48 
 
 
538 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  78.5 
 
 
542 aa  798    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  85.52 
 
 
541 aa  856    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  88.72 
 
 
541 aa  928    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  68.92 
 
 
540 aa  693    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.97 
 
 
544 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
553 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  83.81 
 
 
540 aa  857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.57 
 
 
538 aa  655    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  86.01 
 
 
544 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
536 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
544 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
539 aa  656    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.27 
 
 
536 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  80.41 
 
 
541 aa  836    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  67.42 
 
 
546 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  77 
 
 
541 aa  779    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  82.26 
 
 
540 aa  863    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  67.8 
 
 
549 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
545 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
548 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  83.62 
 
 
540 aa  864    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
544 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
543 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  81.75 
 
 
543 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.48 
 
 
538 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  85.61 
 
 
546 aa  859    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
549 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  87.15 
 
 
542 aa  896    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
541 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  69.41 
 
 
540 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
545 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  65.21 
 
 
535 aa  664    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  79.63 
 
 
540 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  90.76 
 
 
541 aa  953    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  85.33 
 
 
541 aa  884    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.65 
 
 
540 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.06 
 
 
538 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  71.11 
 
 
541 aa  724    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  81.15 
 
 
541 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  69.02 
 
 
541 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  64.24 
 
 
545 aa  655    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  84.93 
 
 
544 aa  877    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  88.66 
 
 
540 aa  906    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  67.18 
 
 
527 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  85.61 
 
 
540 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  64.52 
 
 
541 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  62.84 
 
 
546 aa  668    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
546 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  64.88 
 
 
541 aa  675    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  83.81 
 
 
540 aa  864    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  62.74 
 
 
538 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  69.9 
 
 
542 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  66.36 
 
 
538 aa  696    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  86.28 
 
 
542 aa  869    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  78.19 
 
 
541 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  86.67 
 
 
545 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
536 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  61.12 
 
 
543 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.49 
 
 
547 aa  648    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
542 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  81.89 
 
 
539 aa  855    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  66.41 
 
 
541 aa  684    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  86.88 
 
 
541 aa  857    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  70.19 
 
 
541 aa  728    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  65.27 
 
 
542 aa  671    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  72.91 
 
 
540 aa  758    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  68.76 
 
 
541 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  83.18 
 
 
541 aa  880    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  90.76 
 
 
541 aa  953    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
545 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  89.46 
 
 
541 aa  937    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  64.63 
 
 
539 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
544 aa  674    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>