More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0175 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.86 
 
 		 544 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  86.48 
 
 		 542 aa  895    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 547 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 539 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  67.8 
 
 		 549 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 550 aa  651    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  82.66 
 
 		 541 aa  869    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 547 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.73 
 
 		 540 aa  646    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 544 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 544 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 544 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 536 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  81.41 
 
 		 541 aa  867    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  68.4 
 
 		 537 aa  709    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  80.75 
 
 		 542 aa  850    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 545 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  65.83 
 
 		 547 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 539 aa  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.85 
 
 		 538 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 544 aa  705    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 544 aa  703    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  63.81 
 
 		 543 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 554 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.93 
 
 		 538 aa  678    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  84.26 
 
 		 540 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 541 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  61.88 
 
 		 542 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 541 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 544 aa  707    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 544 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 545 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  68.06 
 
 		 544 aa  719    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 544 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  95.04 
 
 		 545 aa  976    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.93 
 
 		 538 aa  678    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 538 aa  648    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  65.43 
 
 		 539 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  66.54 
 
 		 536 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 547 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  83.02 
 
 		 544 aa  872    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 546 aa  658    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  80.42 
 
 		 541 aa  840    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  92.96 
 
 		 540 aa  995    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  91.94 
 
 		 542 aa  942    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.19 
 
 		 541 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  62.64 
 
 		 544 aa  657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 539 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 542 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 535 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.79 
 
 		 539 aa  682    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.68 
 
 		 553 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.93 
 
 		 545 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 544 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.37 
 
 		 542 aa  726    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 538 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  82.66 
 
 		 541 aa  869    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  63.27 
 
 		 548 aa  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  68.93 
 
 		 540 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  60.78 
 
 		 576 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.3 
 
 		 542 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  62.66 
 
 		 543 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.19 
 
 		 539 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  61.19 
 
 		 539 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  60.59 
 
 		 544 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.39 
 
 		 561 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  63.3 
 
 		 553 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.76 
 
 		 546 aa  685    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 542 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.67 
 
 		 549 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  84.44 
 
 		 540 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  67.59 
 
 		 541 aa  711    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.81 
 
 		 543 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 539 aa  639    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  63.35 
 
 		 539 aa  651    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  82.83 
 
 		 545 aa  867    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 536 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 538 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 545 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  82.83 
 
 		 546 aa  847    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60.83 
 
 		 547 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  87.78 
 
 		 539 aa  933    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  68.19 
 
 		 541 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  63.81 
 
 		 545 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 554 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  62.09 
 
 		 543 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  100 
 
 		 540 aa  1058    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 541 aa  722    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  85.77 
 
 		 541 aa  915    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  82.66 
 
 		 541 aa  869    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 540 aa  639    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  82.66 
 
 		 541 aa  872    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  82.29 
 
 		 541 aa  864    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 547 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  66.92 
 
 		 544 aa  705    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.48 
 
 		 542 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  60.66 
 
 		 543 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  83.14 
 
 		 540 aa  862    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 545 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>