More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0450 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
548 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
548 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
544 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
548 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  61.76 
 
 
545 aa  635    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
546 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
539 aa  707    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.27 
 
 
545 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  57.51 
 
 
542 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
540 aa  696    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
536 aa  674    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  70.67 
 
 
544 aa  753    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  70.86 
 
 
544 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  70.86 
 
 
544 aa  754    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  59.35 
 
 
546 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.63 
 
 
541 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
538 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  61.23 
 
 
542 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  58.85 
 
 
542 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  71.92 
 
 
541 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  60 
 
 
543 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
539 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
544 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
554 aa  648    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  69.58 
 
 
542 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
542 aa  691    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
551 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  61.51 
 
 
547 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  61.32 
 
 
544 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.98 
 
 
547 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
544 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
546 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
548 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
540 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  70.67 
 
 
544 aa  753    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
548 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  59.92 
 
 
555 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  636    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  58.85 
 
 
542 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
548 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  63.97 
 
 
539 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  67.43 
 
 
536 aa  728    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.98 
 
 
547 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  65.12 
 
 
538 aa  720    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.18 
 
 
540 aa  658    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  58.82 
 
 
538 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.4 
 
 
545 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  71.24 
 
 
542 aa  755    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
547 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  65.33 
 
 
541 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  59.31 
 
 
543 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.76 
 
 
547 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  59.35 
 
 
549 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
546 aa  635    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
553 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  58.97 
 
 
545 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  68.75 
 
 
541 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
544 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
541 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
540 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  69.04 
 
 
547 aa  727    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
544 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  58.5 
 
 
542 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
542 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  67.22 
 
 
539 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  66.85 
 
 
539 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
541 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  59.66 
 
 
561 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  61.02 
 
 
544 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0330  chaperonin GroEL  60.45 
 
 
547 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
549 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  66.16 
 
 
546 aa  721    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  59.01 
 
 
551 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  60.7 
 
 
541 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
540 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  62.12 
 
 
542 aa  670    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
541 aa  719    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  65.13 
 
 
543 aa  704    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
539 aa  706    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  65.08 
 
 
539 aa  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  60.68 
 
 
548 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
540 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
543 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
542 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  65.12 
 
 
538 aa  720    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
539 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
540 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
554 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
547 aa  641    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  59.09 
 
 
548 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
543 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  70.29 
 
 
544 aa  754    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  60.22 
 
 
541 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  61.52 
 
 
542 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
541 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  61.07 
 
 
541 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
547 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
544 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
540 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>