More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2313 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
541 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
544 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  82.75 
 
 
545 aa  900    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  63 
 
 
555 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
539 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  82.17 
 
 
543 aa  890    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
553 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  63.72 
 
 
538 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  59.56 
 
 
541 aa  644    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
576 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
538 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  82.35 
 
 
543 aa  892    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
540 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
542 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
544 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
538 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  76.51 
 
 
545 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  89.71 
 
 
544 aa  954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  64.99 
 
 
560 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
544 aa  655    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  86.4 
 
 
542 aa  935    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  61.99 
 
 
539 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  84.74 
 
 
544 aa  909    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
542 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  84.38 
 
 
544 aa  905    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  82.57 
 
 
545 aa  898    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  63.67 
 
 
555 aa  678    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  100 
 
 
544 aa  1081    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.99 
 
 
539 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
536 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.84 
 
 
538 aa  650    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  87.71 
 
 
545 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.18 
 
 
540 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  85.29 
 
 
541 aa  911    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
549 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.9 
 
 
539 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  82.72 
 
 
544 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  82.9 
 
 
543 aa  914    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
546 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
545 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
539 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  60.83 
 
 
543 aa  648    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  657    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.27 
 
 
545 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
538 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  59.29 
 
 
550 aa  642    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  63.6 
 
 
556 aa  679    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  63 
 
 
555 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  90.07 
 
 
543 aa  951    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  85.29 
 
 
541 aa  911    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
561 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  86.95 
 
 
544 aa  928    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  82.9 
 
 
544 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
540 aa  646    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  82.75 
 
 
545 aa  900    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.1 
 
 
543 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.8 
 
 
539 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  62.18 
 
 
541 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  58.93 
 
 
540 aa  635    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  60.63 
 
 
541 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60 
 
 
543 aa  640    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.6 
 
 
547 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.33 
 
 
547 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
541 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
541 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
548 aa  632  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  60.68 
 
 
540 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.27 
 
 
546 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
540 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
541 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  59.23 
 
 
540 aa  628  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  60.91 
 
 
543 aa  631  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
541 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  60.18 
 
 
540 aa  628  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
541 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
540 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
554 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  58.29 
 
 
545 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
540 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
541 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
539 aa  625  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.39 
 
 
546 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
547 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.47 
 
 
547 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
541 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  59.43 
 
 
540 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
542 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
541 aa  622  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  58.17 
 
 
548 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  57.51 
 
 
553 aa  623  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.04 
 
 
541 aa  624  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  58.68 
 
 
536 aa  623  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  58.14 
 
 
544 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>