More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1762 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
547 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
544 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  65.13 
 
 
548 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0550  chaperonin GroEL  61.51 
 
 
550 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000728824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  70.17 
 
 
539 aa  741    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
545 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.93 
 
 
542 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  63.52 
 
 
545 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
544 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  72.91 
 
 
540 aa  783    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
548 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
540 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  72.32 
 
 
544 aa  764    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  72.5 
 
 
544 aa  767    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  72.5 
 
 
544 aa  767    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
547 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
548 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.22 
 
 
542 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
548 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
554 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
539 aa  646    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  72.32 
 
 
544 aa  766    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  67.43 
 
 
544 aa  708    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.25 
 
 
541 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
547 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
545 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
546 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
548 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  72.32 
 
 
544 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
538 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
545 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.85 
 
 
539 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
536 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
550 aa  651    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  60.87 
 
 
547 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
540 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
550 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  79.01 
 
 
542 aa  837    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
542 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  60.79 
 
 
551 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
546 aa  634    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  63.33 
 
 
545 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
547 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7830  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
549 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
549 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.11 
 
 
547 aa  667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  61.91 
 
 
550 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  72.69 
 
 
542 aa  768    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  72.5 
 
 
544 aa  767    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
545 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
546 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.6 
 
 
539 aa  634    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  67.36 
 
 
541 aa  711    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  61.21 
 
 
540 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
543 aa  711    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
544 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
542 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
542 aa  649    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
539 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
539 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  65.16 
 
 
542 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
551 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
544 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
549 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  62.1 
 
 
546 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
540 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  70.43 
 
 
538 aa  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
546 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
549 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  74.57 
 
 
542 aa  772    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  80.78 
 
 
541 aa  876    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  76.85 
 
 
543 aa  828    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  100 
 
 
539 aa  1068    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  73.65 
 
 
539 aa  774    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
545 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
543 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  60.97 
 
 
542 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
546 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  70.43 
 
 
538 aa  759    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
539 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  63.33 
 
 
546 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
554 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
550 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  72.5 
 
 
544 aa  769    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  72.5 
 
 
544 aa  767    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
541 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
548 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
547 aa  646    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  66.99 
 
 
541 aa  712    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  60.7 
 
 
536 aa  663    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
547 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  63.45 
 
 
546 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
547 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  72.32 
 
 
544 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
544 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
547 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  60.79 
 
 
548 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>