More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2066 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  59.81 
 
 
545 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
542 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
545 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  92.82 
 
 
539 aa  983    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  74.58 
 
 
544 aa  794    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0698  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
551 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000118072  unclonable  0.000000000086232 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  100 
 
 
538 aa  1071    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  70.87 
 
 
540 aa  759    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  711    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
546 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  74.39 
 
 
544 aa  793    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  74.58 
 
 
544 aa  794    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  74.58 
 
 
544 aa  794    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.62 
 
 
541 aa  712    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
541 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
538 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7830  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
549 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
545 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
548 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
549 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
538 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.31 
 
 
547 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
540 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60.5 
 
 
547 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.16 
 
 
546 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  74.58 
 
 
544 aa  794    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  74.39 
 
 
544 aa  793    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  60.61 
 
 
546 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  75.51 
 
 
539 aa  818    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  65.33 
 
 
543 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
543 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.39 
 
 
548 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
539 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
536 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  60.31 
 
 
547 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
541 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
540 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  59.43 
 
 
545 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  69.96 
 
 
541 aa  742    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
550 aa  641    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  59.93 
 
 
540 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0542  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
551 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
546 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  60.69 
 
 
547 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
542 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  60.69 
 
 
548 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
550 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
542 aa  703    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
546 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  58.36 
 
 
539 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  62 
 
 
540 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  58.12 
 
 
553 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  67.98 
 
 
547 aa  709    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  60.27 
 
 
542 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  74.02 
 
 
544 aa  795    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  61.15 
 
 
540 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
540 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
540 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62 
 
 
544 aa  646    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.67 
 
 
542 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.09 
 
 
547 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  65.06 
 
 
539 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  65.06 
 
 
539 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
538 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
540 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
546 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  65.7 
 
 
548 aa  708    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
536 aa  681    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.03 
 
 
546 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
551 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  68.27 
 
 
542 aa  724    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  65.8 
 
 
541 aa  731    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  67.16 
 
 
543 aa  734    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  70.43 
 
 
539 aa  759    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  70.87 
 
 
539 aa  743    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  59.93 
 
 
540 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
541 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
540 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
551 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  60.86 
 
 
539 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
541 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  100 
 
 
538 aa  1071    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  74.39 
 
 
544 aa  796    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  64.41 
 
 
542 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  58.82 
 
 
548 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  74.39 
 
 
544 aa  795    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
541 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
546 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
541 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  59.39 
 
 
547 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
539 aa  682    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
542 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  60.31 
 
 
546 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
540 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  74.76 
 
 
542 aa  793    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>