More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0228 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 544 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60.45 
 
 		 543 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  68.95 
 
 		 544 aa  711    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 547 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 539 aa  640    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.41 
 
 		 544 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  61.81 
 
 		 542 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  65.71 
 
 		 543 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 540 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.22 
 
 		 544 aa  669    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.41 
 
 		 544 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.41 
 
 		 544 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.27 
 
 		 548 aa  646    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  100 
 
 		 541 aa  1057    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  68.47 
 
 		 537 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.79 
 
 		 549 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 545 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  79.52 
 
 		 541 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 538 aa  674    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  67.11 
 
 		 542 aa  708    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.41 
 
 		 544 aa  671    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 538 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 544 aa  638    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  79.36 
 
 		 540 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  82.44 
 
 		 541 aa  840    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 548 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 544 aa  636    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  81.41 
 
 		 540 aa  867    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  65.6 
 
 		 542 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  64.03 
 
 		 544 aa  669    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 546 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 548 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.22 
 
 		 544 aa  669    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  64.03 
 
 		 547 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  65.4 
 
 		 549 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 542 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 535 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  80.08 
 
 		 544 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 547 aa  647    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  63.9 
 
 		 539 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.08 
 
 		 536 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.95 
 
 		 538 aa  671    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.95 
 
 		 538 aa  671    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  63.84 
 
 		 547 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  65.91 
 
 		 546 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  80.34 
 
 		 541 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  80.67 
 
 		 540 aa  852    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 538 aa  647    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  63.09 
 
 		 547 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  83.4 
 
 		 542 aa  854    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  68.46 
 
 		 541 aa  706    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  79.15 
 
 		 541 aa  829    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 539 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 539 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  79.34 
 
 		 542 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.62 
 
 		 553 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  64.04 
 
 		 545 aa  676    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 543 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  66.11 
 
 		 539 aa  707    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 538 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  79.15 
 
 		 541 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 541 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 540 aa  704    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  78.18 
 
 		 542 aa  809    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.62 
 
 		 542 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.92 
 
 		 542 aa  674    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 539 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 539 aa  641    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.41 
 
 		 544 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  79.7 
 
 		 546 aa  804    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  80.89 
 
 		 540 aa  857    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  65.27 
 
 		 546 aa  689    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  80.89 
 
 		 540 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  63.84 
 
 		 547 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  65.71 
 
 		 545 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 547 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.68 
 
 		 541 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 536 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.6 
 
 		 544 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  68.39 
 
 		 540 aa  708    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 539 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  79.66 
 
 		 545 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  63.05 
 
 		 536 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  66.16 
 
 		 547 aa  690    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.44 
 
 		 542 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  74.58 
 
 		 540 aa  784    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 547 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  80.52 
 
 		 540 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  83.58 
 
 		 539 aa  875    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  67.81 
 
 		 541 aa  696    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 554 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  81.42 
 
 		 545 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  64.69 
 
 		 544 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.55 
 
 		 544 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  66.16 
 
 		 541 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  81.48 
 
 		 541 aa  867    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  79.15 
 
 		 541 aa  829    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.99 
 
 		 550 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  79.52 
 
 		 541 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>