More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1855 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  66.28 
 
 		 548 aa  712    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 544 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  61.65 
 
 		 538 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  62.14 
 
 		 545 aa  643    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  58.2 
 
 		 544 aa  644    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  61.69 
 
 		 539 aa  674    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 545 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.22 
 
 		 542 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 540 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  69.54 
 
 		 544 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  69.54 
 
 		 544 aa  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  69.54 
 
 		 544 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  65.46 
 
 		 538 aa  689    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  64.44 
 
 		 541 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 537 aa  663    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  58.52 
 
 		 547 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  59.67 
 
 		 542 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 545 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  65.46 
 
 		 538 aa  689    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 546 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 560 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  59.35 
 
 		 544 aa  648    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.7 
 
 		 544 aa  663    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 551 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 548 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  64.04 
 
 		 542 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.02 
 
 		 547 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  63.67 
 
 		 545 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 546 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.17 
 
 		 548 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 549 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  69.54 
 
 		 544 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  61.65 
 
 		 538 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 555 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  65.39 
 
 		 540 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  61.69 
 
 		 540 aa  641    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60 
 
 		 543 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 548 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  68.6 
 
 		 539 aa  757    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 536 aa  732    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 545 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 547 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 536 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.07 
 
 		 541 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 540 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 550 aa  657    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 538 aa  659    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 544 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 549 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 544 aa  654    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 546 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  64.44 
 
 		 542 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.52 
 
 		 553 aa  646    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 545 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  69.2 
 
 		 542 aa  732    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 576 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 539 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.34 
 
 		 541 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 540 aa  680    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  63.41 
 
 		 540 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 544 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 542 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 542 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  64.81 
 
 		 539 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.56 
 
 		 539 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 561 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1077    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 539 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 542 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  58.92 
 
 		 542 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 542 aa  658    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.7 
 
 		 541 aa  648    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 543 aa  669    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 539 aa  672    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.88 
 
 		 539 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  62.91 
 
 		 545 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  59.36 
 
 		 536 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 543 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 541 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  67.78 
 
 		 541 aa  728    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  64.86 
 
 		 539 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  61.07 
 
 		 541 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  69.16 
 
 		 544 aa  727    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  68.97 
 
 		 547 aa  732    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 541 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 541 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.34 
 
 		 541 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 541 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  60.95 
 
 		 547 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 546 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 547 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 540 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  59.52 
 
 		 543 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.07 
 
 		 543 aa  660    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  68.89 
 
 		 541 aa  738    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  65.39 
 
 		 540 aa  689    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.34 
 
 		 541 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  63.36 
 
 		 540 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  61.18 
 
 		 542 aa  675    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  71.48 
 
 		 542 aa  750    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>