More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0224 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.21 
 
 
547 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  64 
 
 
544 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.89 
 
 
544 aa  647    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
539 aa  666    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  100 
 
 
536 aa  1039    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
540 aa  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
538 aa  675    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.65 
 
 
541 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.75 
 
 
539 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  62.33 
 
 
548 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
538 aa  696    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  61.61 
 
 
540 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
544 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  61.94 
 
 
538 aa  670    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
542 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
547 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
546 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  61.92 
 
 
541 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
546 aa  651    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.73 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
539 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  58.86 
 
 
536 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  61.77 
 
 
547 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  59.92 
 
 
554 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
538 aa  665    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  62.59 
 
 
543 aa  676    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
541 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
539 aa  670    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
539 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
546 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.84 
 
 
547 aa  682    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.11 
 
 
549 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
538 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.21 
 
 
547 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  59.59 
 
 
539 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
543 aa  650    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  60.59 
 
 
540 aa  651    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  69.96 
 
 
540 aa  743    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.5 
 
 
539 aa  660    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
539 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  64.17 
 
 
544 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  65.1 
 
 
542 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.97 
 
 
548 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0840  chaperonin GroEL  65.6 
 
 
533 aa  704    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.6 
 
 
546 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
547 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  57.86 
 
 
541 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
543 aa  653    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  60.7 
 
 
539 aa  663    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
539 aa  660    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
548 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
553 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  60.27 
 
 
543 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.3 
 
 
538 aa  692    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  61.58 
 
 
547 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
538 aa  681    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
538 aa  675    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
554 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
546 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
542 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.54 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.12 
 
 
541 aa  648    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
547 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
539 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.07 
 
 
547 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
545 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
545 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
542 aa  632  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  60 
 
 
551 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
545 aa  633  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
545 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
550 aa  630  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
551 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  60.87 
 
 
546 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  59.58 
 
 
542 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  57.9 
 
 
544 aa  629  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  60.87 
 
 
546 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  60 
 
 
540 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  58.54 
 
 
542 aa  630  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1767  chaperonin GroEL  59.01 
 
 
548 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  59.25 
 
 
548 aa  628  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
560 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  59.81 
 
 
540 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
542 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
547 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  59.18 
 
 
548 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
549 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  59.4 
 
 
540 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  58.52 
 
 
553 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  57.28 
 
 
540 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  59.93 
 
 
539 aa  626  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
541 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  57.73 
 
 
542 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  59.18 
 
 
540 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>