More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1175 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 536 aa  647    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  61.44 
 
 		 544 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 544 aa  636    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  64.58 
 
 		 544 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 546 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 545 aa  645    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  100 
 
 		 544 aa  1083    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.19 
 
 		 545 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.44 
 
 		 542 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 547 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.01 
 
 		 545 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 547 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 544 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 544 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 544 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 550 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 546 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 545 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 547 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  60.71 
 
 		 547 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.89 
 
 		 542 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 545 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 548 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.27 
 
 		 554 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.79 
 
 		 547 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  63.71 
 
 		 551 aa  646    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 546 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 539 aa  657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  63.21 
 
 		 547 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  64.33 
 
 		 547 aa  669    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.97 
 
 		 546 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.31 
 
 		 548 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  60.23 
 
 		 544 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 544 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 552 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 543 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 548 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 539 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  58.98 
 
 		 536 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 549 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  60.87 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 548 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  63.3 
 
 		 547 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 550 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  60.56 
 
 		 550 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 547 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 546 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 552 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60.6 
 
 		 547 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  60 
 
 		 551 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  60.7 
 
 		 544 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 550 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  61.06 
 
 		 541 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 540 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 538 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 546 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1863  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 550 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3153  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.93 
 
 		 550 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 549 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  59.55 
 
 		 546 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 549 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 546 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.09 
 
 		 553 aa  662    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.39 
 
 		 545 aa  658    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.61 
 
 		 547 aa  652    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 547 aa  634    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  59.37 
 
 		 539 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1842  chaperonin GroEL  63.04 
 
 		 543 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.399369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  59.23 
 
 		 544 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 540 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 542 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  60.68 
 
 		 550 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.38 
 
 		 542 aa  660    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  63.4 
 
 		 542 aa  667    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.72 
 
 		 539 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  61.21 
 
 		 539 aa  663    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0699  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 546 aa  634    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.0116796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 548 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  58.94 
 
 		 546 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 551 aa  655    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 546 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  61.06 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  60.79 
 
 		 546 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  62 
 
 		 541 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  63.83 
 
 		 543 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 542 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  64.93 
 
 		 549 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 547 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 554 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  63.21 
 
 		 547 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 545 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 545 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  60.76 
 
 		 549 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 541 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.01 
 
 		 545 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  64.03 
 
 		 544 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>