More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2493 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
540 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.05 
 
 
544 aa  668    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
547 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
538 aa  713    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
547 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
539 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
538 aa  664    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5249  chaperonin GroEL  61.88 
 
 
546 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  63 
 
 
545 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  62.96 
 
 
540 aa  676    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
542 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
541 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
548 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  69.23 
 
 
536 aa  745    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  64.58 
 
 
538 aa  671    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  61.49 
 
 
545 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
553 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  65.77 
 
 
544 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  64.35 
 
 
548 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0673  chaperonin GroEL  61.3 
 
 
545 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
540 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
544 aa  652    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  62.12 
 
 
547 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
547 aa  651    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.06 
 
 
541 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
547 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.16 
 
 
547 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
546 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
548 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
544 aa  690    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  62.04 
 
 
538 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
547 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000396118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  62.25 
 
 
540 aa  653    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  61.57 
 
 
546 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
548 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
539 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
536 aa  668    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
538 aa  677    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
541 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60 
 
 
540 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  61.07 
 
 
542 aa  645    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
543 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
549 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
541 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  63.03 
 
 
540 aa  651    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
548 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  61.88 
 
 
546 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
549 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
553 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
549 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
546 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
550 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  65.66 
 
 
547 aa  696    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
541 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
541 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
540 aa  640    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  61.92 
 
 
543 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1034  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
545 aa  654    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  66.23 
 
 
539 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  62.22 
 
 
539 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  62.76 
 
 
539 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
539 aa  672    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
538 aa  677    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
544 aa  640    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  64.35 
 
 
546 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  65.18 
 
 
539 aa  678    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  62.04 
 
 
538 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
542 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  59.41 
 
 
541 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  62.85 
 
 
543 aa  670    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  62.78 
 
 
539 aa  676    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.85 
 
 
539 aa  653    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
544 aa  653    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
543 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
550 aa  659    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.99 
 
 
539 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
545 aa  651    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  64.19 
 
 
554 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
547 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
547 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.41 
 
 
542 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
540 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.11 
 
 
541 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
541 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
541 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.98 
 
 
547 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
542 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  64.34 
 
 
543 aa  668    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
545 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
545 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  65.59 
 
 
544 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  61.76 
 
 
546 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>