More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0392 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  63.23 
 
 		 550 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  63.95 
 
 		 544 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.99 
 
 		 544 aa  670    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 539 aa  686    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.52 
 
 		 542 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 545 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  67.9 
 
 		 540 aa  736    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 544 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 544 aa  766    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 544 aa  766    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.09 
 
 		 545 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.37 
 
 		 541 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 538 aa  671    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  64.51 
 
 		 538 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 548 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  61.88 
 
 		 542 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 554 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.67 
 
 		 547 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2770  chaperonin GroEL  63.64 
 
 		 551 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.43 
 
 		 540 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 542 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 542 aa  696    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  64.02 
 
 		 546 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  60.6 
 
 		 548 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1470  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 544 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  60.56 
 
 		 555 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  60 
 
 		 544 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 547 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 539 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  67.17 
 
 		 536 aa  709    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  71.89 
 
 		 542 aa  749    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  60.95 
 
 		 548 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  63.06 
 
 		 547 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  61.75 
 
 		 540 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 550 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 542 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  71.24 
 
 		 541 aa  761    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 547 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 546 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 551 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  59.58 
 
 		 544 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  61.39 
 
 		 547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 542 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 540 aa  656    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 546 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  71.43 
 
 		 544 aa  764    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  72.49 
 
 		 541 aa  777    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.07 
 
 		 553 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  60.85 
 
 		 545 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  72.37 
 
 		 544 aa  766    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  64.51 
 
 		 538 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  62.85 
 
 		 547 aa  653    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.69 
 
 		 541 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  66.23 
 
 		 540 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  63.18 
 
 		 549 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.04 
 
 		 542 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 542 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  73.66 
 
 		 539 aa  781    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  73.48 
 
 		 539 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  71.46 
 
 		 547 aa  733    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 543 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 540 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.51 
 
 		 544 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  66.41 
 
 		 546 aa  708    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 541 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  64.77 
 
 		 539 aa  681    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  66.3 
 
 		 542 aa  690    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  65.25 
 
 		 541 aa  714    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  65.56 
 
 		 543 aa  707    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 539 aa  716    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  68.33 
 
 		 539 aa  727    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.49 
 
 		 538 aa  686    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.69 
 
 		 541 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 543 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 542 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.93 
 
 		 545 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 539 aa  658    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 536 aa  677    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 540 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 554 aa  651    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  60.79 
 
 		 546 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 545 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 545 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 541 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.88 
 
 		 541 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  61.13 
 
 		 546 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.69 
 
 		 541 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  60.77 
 
 		 541 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.32 
 
 		 547 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  64.56 
 
 		 540 aa  660    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 550 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  64.49 
 
 		 538 aa  686    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  64.27 
 
 		 549 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2567  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 552 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164094  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 548 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  69.87 
 
 		 548 aa  740    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  85.2 
 
 		 541 aa  899    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 547 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>