More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0430 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  61.36 
 
 
544 aa  637    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
544 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
540 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
544 aa  674    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.27 
 
 
539 aa  645    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
549 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
576 aa  636    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2779  chaperonin GroEL  60.18 
 
 
546 aa  647    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
545 aa  647    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  62.13 
 
 
540 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.37 
 
 
544 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.37 
 
 
544 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
538 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  64.95 
 
 
541 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.84 
 
 
537 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.88 
 
 
547 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
540 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
542 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.74 
 
 
545 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
548 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.38 
 
 
549 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
560 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  64.39 
 
 
542 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
547 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
544 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
542 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
542 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
546 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
548 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
544 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  63.96 
 
 
547 aa  661    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  100 
 
 
538 aa  1058    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
547 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
552 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.86 
 
 
543 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
548 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
539 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  64.2 
 
 
536 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  61.32 
 
 
548 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
547 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  64.15 
 
 
541 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  64.74 
 
 
540 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  60.86 
 
 
550 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
541 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
548 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  61.7 
 
 
552 aa  656    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  64.06 
 
 
543 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1077  chaperonin GroEL  60 
 
 
546 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
540 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
540 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  64.25 
 
 
544 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
542 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
550 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
541 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
546 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  86.75 
 
 
539 aa  932    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.76 
 
 
545 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
553 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  64.72 
 
 
545 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
547 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.74 
 
 
542 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.52 
 
 
539 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
545 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
541 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
540 aa  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  61.1 
 
 
547 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
544 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
542 aa  668    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1671  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
547 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  63.72 
 
 
539 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  63.91 
 
 
539 aa  676    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  60.89 
 
 
545 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
540 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  65.46 
 
 
546 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  61.11 
 
 
551 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  63 
 
 
541 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
536 aa  675    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
538 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
543 aa  647    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
542 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.57 
 
 
539 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
545 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
546 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
546 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  63.77 
 
 
543 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  61.27 
 
 
543 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  59.4 
 
 
551 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  65.67 
 
 
539 aa  690    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  61.84 
 
 
541 aa  653    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
545 aa  656    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
554 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  61.98 
 
 
547 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  86.96 
 
 
538 aa  931    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
544 aa  665    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
541 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
541 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
541 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.14 
 
 
541 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
547 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>