More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0957 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 548 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 548 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 544 aa  658    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  65.72 
 
 		 544 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 546 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  65.33 
 
 		 545 aa  680    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  659    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.61 
 
 		 539 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 545 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  63.41 
 
 		 542 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  63.47 
 
 		 540 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 545 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  67.04 
 
 		 544 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 544 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  67.23 
 
 		 544 aa  691    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 550 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 547 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  64.96 
 
 		 541 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  63.99 
 
 		 542 aa  679    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  63.64 
 
 		 545 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 548 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  61.65 
 
 		 545 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  63.28 
 
 		 560 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 554 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 547 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 547 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  63.17 
 
 		 547 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  65.4 
 
 		 546 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  63.6 
 
 		 548 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.33 
 
 		 544 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  67.04 
 
 		 544 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 544 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 552 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 543 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  63.18 
 
 		 548 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  68.97 
 
 		 539 aa  738    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  69.58 
 
 		 536 aa  727    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 548 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  66.04 
 
 		 547 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 541 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  64.29 
 
 		 540 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  62.76 
 
 		 550 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 546 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 551 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 544 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 550 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 540 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 540 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 545 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  62.76 
 
 		 550 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 547 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 546 aa  660    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 546 aa  654    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 553 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  63.91 
 
 		 545 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  61.73 
 
 		 547 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 547 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  63.27 
 
 		 539 aa  675    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  62.2 
 
 		 540 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  64.54 
 
 		 541 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 540 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  63.91 
 
 		 544 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 542 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 542 aa  680    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 539 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  65.97 
 
 		 539 aa  684    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 547 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 561 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 544 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 545 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 545 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  66.1 
 
 		 546 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  61.77 
 
 		 551 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  60.93 
 
 		 540 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  63.1 
 
 		 547 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  63.18 
 
 		 543 aa  668    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 545 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  62.2 
 
 		 540 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  64.27 
 
 		 543 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 542 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 545 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.85 
 
 		 539 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  66.48 
 
 		 554 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.19 
 
 		 547 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 545 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 545 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 541 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  65.23 
 
 		 541 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 545 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  64.54 
 
 		 541 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  65.33 
 
 		 541 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  63.89 
 
 		 547 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  61.38 
 
 		 549 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  64.46 
 
 		 544 aa  662    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 550 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0428  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 548 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 550 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>