More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0840 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  59.66 
 
 
539 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
538 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  61.61 
 
 
541 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
542 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  62.13 
 
 
539 aa  655    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0840  chaperonin GroEL  100 
 
 
533 aa  1047    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
539 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
538 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  65.6 
 
 
536 aa  704    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
548 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
540 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.21 
 
 
538 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  70.86 
 
 
540 aa  748    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
544 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  60.45 
 
 
544 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  60.08 
 
 
544 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  61.86 
 
 
547 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.21 
 
 
538 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
538 aa  638    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
538 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
538 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
542 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
541 aa  630  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
554 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
539 aa  631  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  58.27 
 
 
540 aa  625  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  58.86 
 
 
541 aa  626  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
536 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
539 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.62 
 
 
546 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  59.25 
 
 
539 aa  627  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  60 
 
 
540 aa  626  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  59.69 
 
 
544 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
546 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  60.81 
 
 
544 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  59.1 
 
 
543 aa  624  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.39 
 
 
546 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
539 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  58.54 
 
 
549 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  59.59 
 
 
543 aa  619  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  59.5 
 
 
547 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
541 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  58.81 
 
 
539 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  58.81 
 
 
539 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  59.93 
 
 
543 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  58.08 
 
 
552 aa  612  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  59.55 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0755  chaperonin GroEL  58.99 
 
 
546 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  58.27 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
538 aa  611  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  57.2 
 
 
542 aa  611  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  57.41 
 
 
539 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
544 aa  610  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  58.54 
 
 
547 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  58.73 
 
 
548 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  58.35 
 
 
547 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  56.95 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0957  chaperone protein GroEL  57.68 
 
 
548 aa  605  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10436  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  55.72 
 
 
541 aa  605  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4600  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
542 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4727  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4748  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.729761  normal  0.333677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4691  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1034  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226771  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4608  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03975  hypothetical protein  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  58.8 
 
 
545 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3869  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.749849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  58.94 
 
 
549 aa  599  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4672  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  57.22 
 
 
548 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3403  chaperonin GroEL  58.19 
 
 
548 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  58.33 
 
 
544 aa  600  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5659  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0472  chaperonin GroEL  59.15 
 
 
549 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03918  chaperonin GroEL  57.97 
 
 
546 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  59.58 
 
 
545 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3529  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
548 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.249463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4612  chaperonin GroEL  57.52 
 
 
548 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.562715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3689  chaperonin GroEL  58.48 
 
 
547 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  58.8 
 
 
545 aa  598  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
545 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  56.82 
 
 
550 aa  597  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0330  chaperonin GroEL  57.8 
 
 
547 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  56.95 
 
 
548 aa  596  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  56.65 
 
 
543 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  58.77 
 
 
547 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  57.8 
 
 
548 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0844  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  57.04 
 
 
544 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>