More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3766 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.01 
 
 
541 aa  639    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
544 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
543 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
539 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
543 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  60.73 
 
 
540 aa  636    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
547 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.98 
 
 
542 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
544 aa  664    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
538 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
538 aa  671    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  78.71 
 
 
555 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  63.58 
 
 
543 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1783  chaperonin GroEL  61.91 
 
 
560 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
542 aa  667    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
545 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  65.28 
 
 
544 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  100 
 
 
560 aa  1088    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  61.36 
 
 
547 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  64.11 
 
 
544 aa  675    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1747  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
562 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0615  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
559 aa  646    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
544 aa  669    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
546 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  85.88 
 
 
576 aa  907    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
545 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  70.6 
 
 
555 aa  754    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  65.09 
 
 
544 aa  672    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  78.71 
 
 
555 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.97 
 
 
539 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
536 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
547 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
548 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
545 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
545 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.16 
 
 
549 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
547 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
541 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  61.16 
 
 
547 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06501  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
564 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  64.3 
 
 
544 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  74.95 
 
 
553 aa  807    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  63.39 
 
 
539 aa  666    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
547 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  63.28 
 
 
538 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  63.96 
 
 
544 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.21 
 
 
553 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.2 
 
 
545 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
544 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  63.9 
 
 
545 aa  677    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.85 
 
 
542 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
542 aa  634    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
547 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
544 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  78.15 
 
 
561 aa  823    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04501  chaperonin GroEL  61.08 
 
 
565 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.383214  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  63.03 
 
 
543 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  63.24 
 
 
546 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05061  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
563 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  65.84 
 
 
539 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  78.61 
 
 
556 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
538 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  66.17 
 
 
542 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  64.44 
 
 
538 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  63.72 
 
 
545 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  62.38 
 
 
540 aa  649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
554 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  59.2 
 
 
545 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  59.4 
 
 
550 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
541 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.23 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  60.87 
 
 
543 aa  656    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
539 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
540 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  60.68 
 
 
545 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  61.15 
 
 
540 aa  634  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  59.4 
 
 
554 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
541 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  62.25 
 
 
540 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  60.49 
 
 
547 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0439  chaperonin GroEL  59.66 
 
 
546 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000414877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
547 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
544 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  61.33 
 
 
541 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  59.32 
 
 
554 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
546 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
547 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  61.76 
 
 
547 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>