More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0444 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 544 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 546 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 545 aa  634    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.22 
 
 		 544 aa  649    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 539 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  63.05 
 
 		 545 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  61.51 
 
 		 542 aa  648    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  62.79 
 
 		 547 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 540 aa  652    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  65.9 
 
 		 544 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 544 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.1 
 
 		 544 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  62.03 
 
 		 546 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.16 
 
 		 542 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  68.21 
 
 		 541 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  69.67 
 
 		 537 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  62.76 
 
 		 547 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  69.24 
 
 		 541 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 560 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.44 
 
 		 542 aa  718    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4363  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 546 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.594439  normal  0.0391228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  63.36 
 
 		 546 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  69.44 
 
 		 540 aa  735    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 546 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.41 
 
 		 548 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0346  chaperonin Cpn60/TCP-1  61.89 
 
 		 544 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000118378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  65.9 
 
 		 544 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  63.86 
 
 		 555 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 552 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.77 
 
 		 543 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 539 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  62.27 
 
 		 539 aa  671    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 536 aa  694    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  63.15 
 
 		 546 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  63.93 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 547 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.41 
 
 		 546 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  67.74 
 
 		 541 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 540 aa  739    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 549 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.88 
 
 		 547 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  63.2 
 
 		 544 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  61.07 
 
 		 550 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  70.72 
 
 		 542 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 546 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 543 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 544 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  61.32 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  61.52 
 
 		 547 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 541 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 553 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  65.01 
 
 		 545 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  69.35 
 
 		 542 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0428  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 548 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  63.55 
 
 		 546 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  69.24 
 
 		 541 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  65.65 
 
 		 538 aa  688    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  69.85 
 
 		 540 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  70.53 
 
 		 540 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  61.22 
 
 		 548 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 542 aa  648    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 539 aa  670    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 539 aa  670    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3153  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.84 
 
 		 561 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  60.76 
 
 		 553 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  65.02 
 
 		 546 aa  691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 551 aa  642    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  63.55 
 
 		 546 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3117  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.222092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  59.19 
 
 		 538 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 545 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  59.56 
 
 		 541 aa  652    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.33 
 
 		 543 aa  649    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  60.66 
 
 		 539 aa  646    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3688  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 548 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  68.49 
 
 		 545 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 536 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  63.55 
 
 		 546 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2237  chaperonin GroEL  62 
 
 		 544 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 543 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  69.67 
 
 		 541 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  70.34 
 
 		 540 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  72.39 
 
 		 539 aa  743    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  68.36 
 
 		 541 aa  709    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 554 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  63.09 
 
 		 543 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 542 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1863  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  69.01 
 
 		 541 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  69.61 
 
 		 541 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  69.24 
 
 		 541 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  69.49 
 
 		 541 aa  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.35 
 
 		 547 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  59.19 
 
 		 538 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  61.39 
 
 		 576 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>