More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6543 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  68.18 
 
 		 549 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  67.35 
 
 		 537 aa  695    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  67.49 
 
 		 543 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4924  chaperonin GroEL  73.19 
 
 		 541 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  73.81 
 
 		 540 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  62.59 
 
 		 542 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  70.64 
 
 		 543 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 541 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  64.39 
 
 		 544 aa  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 540 aa  649    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  63.62 
 
 		 541 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  65.6 
 
 		 539 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  66.85 
 
 		 537 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 541 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13451  chaperonin GroEL  70.23 
 
 		 539 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000682478  hitchhiker  0.00665427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  66.92 
 
 		 527 aa  682    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  62.03 
 
 		 539 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 541 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  66.6 
 
 		 541 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.6 
 
 		 545 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.18 
 
 		 542 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  65.06 
 
 		 536 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  62.59 
 
 		 540 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  63.38 
 
 		 538 aa  650    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  70.32 
 
 		 546 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  61.08 
 
 		 544 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.57 
 
 		 540 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 536 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  63.21 
 
 		 544 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.86 
 
 		 546 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  63.06 
 
 		 540 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 541 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  66.35 
 
 		 541 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  72.27 
 
 		 537 aa  720    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  63.96 
 
 		 542 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.2 
 
 		 536 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  68.18 
 
 		 545 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  64.57 
 
 		 542 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  63.43 
 
 		 540 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 541 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  73.81 
 
 		 540 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 540 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  62.41 
 
 		 535 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  63.6 
 
 		 543 aa  635    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  100 
 
 		 541 aa  1057    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  63.45 
 
 		 540 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  63.94 
 
 		 536 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  62.98 
 
 		 542 aa  634    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  65.34 
 
 		 541 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  64.61 
 
 		 539 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  63.02 
 
 		 541 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.24 
 
 		 540 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 541 aa  644    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  69.39 
 
 		 541 aa  714    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.38 
 
 		 541 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 541 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  73.81 
 
 		 540 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 541 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  72.64 
 
 		 544 aa  720    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  63.81 
 
 		 540 aa  644    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  79.52 
 
 		 534 aa  842    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  67.86 
 
 		 540 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  63.81 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 541 aa  631  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  62.83 
 
 		 546 aa  631  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  61.6 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 540 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  63.43 
 
 		 545 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  61.96 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 541 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  63.07 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.08 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 541 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  58.47 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  60.98 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  60.64 
 
 		 539 aa  626  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 547 aa  621  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  58.72 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 543 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  60 
 
 		 547 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.91 
 
 		 539 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  60.86 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  60.95 
 
 		 540 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  58.67 
 
 		 541 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  59.32 
 
 		 538 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  57.79 
 
 		 550 aa  610  1e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  56.17 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  58.27 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  58.16 
 
 		 540 aa  608  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  58.26 
 
 		 542 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  58.9 
 
 		 547 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  58.71 
 
 		 547 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  58.71 
 
 		 547 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>