More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0899 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  64.57 
 
 		 543 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  100 
 
 		 537 aa  1050    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  62.59 
 
 		 537 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13451  chaperonin GroEL  68 
 
 		 539 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000682478  hitchhiker  0.00665427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4924  chaperonin GroEL  72.45 
 
 		 541 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  73.1 
 
 		 537 aa  749    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  72.21 
 
 		 540 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 536 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  60.48 
 
 		 538 aa  638    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  60.93 
 
 		 535 aa  635    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  61 
 
 		 536 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  72.21 
 
 		 540 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  72.64 
 
 		 544 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  67.93 
 
 		 541 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  66.05 
 
 		 534 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  72.21 
 
 		 540 aa  728    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  65.66 
 
 		 546 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 541 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 541 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  61.55 
 
 		 527 aa  628  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  63.14 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 541 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 540 aa  628  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 536 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 540 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 544 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 543 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 549 aa  611  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 541 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 541 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 541 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 542 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  60.76 
 
 		 540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  58.58 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  60.69 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 541 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  60.5 
 
 		 540 aa  601  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  60.5 
 
 		 541 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 538 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 541 aa  601  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  60.95 
 
 		 547 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  57.31 
 
 		 536 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  59.14 
 
 		 540 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 540 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  58.65 
 
 		 543 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  57.01 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  58.06 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 542 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  58.37 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  58.81 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  57.9 
 
 		 541 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  58.4 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  59.24 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.32 
 
 		 539 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  59.92 
 
 		 542 aa  588  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  58.91 
 
 		 539 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  57.2 
 
 		 544 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  59.58 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  59.24 
 
 		 544 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  56.74 
 
 		 538 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 545 aa  588  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  58.63 
 
 		 540 aa  586  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  56.74 
 
 		 538 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  59.05 
 
 		 545 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  58.97 
 
 		 541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  57.09 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  59.39 
 
 		 542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  57.97 
 
 		 547 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  59.43 
 
 		 546 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  59.08 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  58.78 
 
 		 541 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  55.58 
 
 		 550 aa  578  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  57.71 
 
 		 540 aa  578  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  56.17 
 
 		 543 aa  579  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  55.68 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 541 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  57.84 
 
 		 540 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  58.91 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  56.9 
 
 		 546 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  56.87 
 
 		 543 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 544 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  57.06 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  58.43 
 
 		 542 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  57.44 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  57.79 
 
 		 543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  57.6 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  57.25 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  57.25 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  57.39 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  57.84 
 
 		 546 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>