More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4025 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  65.65 
 
 
541 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  65.72 
 
 
540 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  64.57 
 
 
547 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  100 
 
 
536 aa  1052    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
541 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
540 aa  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
544 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  66.41 
 
 
539 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
541 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  61.7 
 
 
546 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
538 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  65.01 
 
 
541 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  83.83 
 
 
537 aa  886    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  70.83 
 
 
527 aa  732    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  63.62 
 
 
534 aa  678    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.91 
 
 
538 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
541 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
543 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
540 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  67.68 
 
 
541 aa  688    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
543 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
542 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
550 aa  637    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.65 
 
 
539 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  58.65 
 
 
538 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  73.77 
 
 
540 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  68.77 
 
 
536 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.77 
 
 
544 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  63.84 
 
 
543 aa  675    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
541 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
539 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
536 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
538 aa  640    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  63.67 
 
 
543 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  63.95 
 
 
543 aa  661    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  71.18 
 
 
546 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
541 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  66.41 
 
 
540 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  66.67 
 
 
540 aa  697    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  65.4 
 
 
541 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
542 aa  681    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  68.5 
 
 
544 aa  720    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  63.58 
 
 
545 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  67.86 
 
 
546 aa  675    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  71.21 
 
 
549 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
542 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  74 
 
 
542 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
540 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
540 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
540 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
540 aa  652    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  78.37 
 
 
541 aa  826    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  61.69 
 
 
554 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  66.35 
 
 
546 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
541 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.99 
 
 
539 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  69.32 
 
 
545 aa  720    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.61 
 
 
546 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  65.9 
 
 
541 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
549 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  63.38 
 
 
544 aa  653    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  65.91 
 
 
544 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  68.37 
 
 
543 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  65.91 
 
 
545 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  68.4 
 
 
536 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  67.1 
 
 
538 aa  718    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  63.88 
 
 
541 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
540 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  64.77 
 
 
542 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
539 aa  686    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  69.01 
 
 
541 aa  719    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  67.35 
 
 
535 aa  732    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.17 
 
 
547 aa  675    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  65.52 
 
 
540 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
540 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  73.67 
 
 
541 aa  769    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  66.86 
 
 
541 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
540 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
541 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  61.52 
 
 
545 aa  635    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  78.03 
 
 
540 aa  800    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
540 aa  668    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  65.09 
 
 
542 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  61.39 
 
 
546 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  65.52 
 
 
542 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  65.65 
 
 
542 aa  671    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  76.66 
 
 
541 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  63.89 
 
 
541 aa  677    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  67.05 
 
 
545 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
544 aa  632  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  61.89 
 
 
546 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
544 aa  633  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>