More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
540 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
540 aa  634    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  65.96 
 
 
540 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
541 aa  703    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
537 aa  693    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
539 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  66.86 
 
 
549 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  62.72 
 
 
541 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
544 aa  663    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  63.93 
 
 
541 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  67.5 
 
 
540 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
540 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  100 
 
 
534 aa  1048    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  63.31 
 
 
540 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
536 aa  634    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  80.23 
 
 
541 aa  821    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.86 
 
 
546 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
540 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  70.51 
 
 
540 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  69.32 
 
 
543 aa  705    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  64.76 
 
 
541 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.82 
 
 
542 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  69.77 
 
 
546 aa  700    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  66.05 
 
 
537 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
540 aa  644    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  70.51 
 
 
540 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4924  chaperonin GroEL  71.1 
 
 
541 aa  673    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.25 
 
 
541 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  62.5 
 
 
538 aa  660    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  63.81 
 
 
535 aa  664    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  69.46 
 
 
537 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
540 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
541 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  68.38 
 
 
545 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  64.43 
 
 
536 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  67.49 
 
 
543 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  64.43 
 
 
536 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  64.71 
 
 
539 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
541 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  63.62 
 
 
536 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
540 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  66.73 
 
 
541 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
541 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  70.51 
 
 
540 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.12 
 
 
541 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  70.32 
 
 
544 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  65.59 
 
 
527 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  62.79 
 
 
541 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
544 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
545 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
541 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  59.32 
 
 
538 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  59.59 
 
 
539 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13451  chaperonin GroEL  66.86 
 
 
539 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000682478  hitchhiker  0.00665427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
541 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
550 aa  625  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
544 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  58.59 
 
 
539 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  59.24 
 
 
546 aa  626  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
541 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  60.99 
 
 
541 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
542 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
542 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
542 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  62.86 
 
 
542 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
545 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  58.97 
 
 
538 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  58.19 
 
 
547 aa  618  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.83 
 
 
541 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
541 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.68 
 
 
539 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
540 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  61.9 
 
 
542 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
540 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  62.21 
 
 
547 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  60.88 
 
 
543 aa  621  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  58.79 
 
 
541 aa  615  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
539 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  60.27 
 
 
542 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  62.29 
 
 
546 aa  617  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  59.58 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
545 aa  612  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
540 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
543 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  60.61 
 
 
544 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
543 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  56.57 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  59.42 
 
 
547 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
541 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  58.33 
 
 
553 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  57.87 
 
 
538 aa  606  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  58.86 
 
 
547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  58.71 
 
 
547 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  58.86 
 
 
547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  56.93 
 
 
543 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  58.8 
 
 
546 aa  601  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  58.67 
 
 
546 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>