More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4452 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  63.07 
 
 		 541 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  71.13 
 
 		 540 aa  721    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  65.5 
 
 		 538 aa  681    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  63.95 
 
 		 544 aa  650    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  64.23 
 
 		 542 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  100 
 
 		 546 aa  1065    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  69.07 
 
 		 534 aa  722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  61.11 
 
 		 541 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  67.65 
 
 		 537 aa  695    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  62.78 
 
 		 540 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  63.98 
 
 		 540 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  63.13 
 
 		 541 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  63.69 
 
 		 542 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 542 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  70.4 
 
 		 542 aa  705    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 541 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  63.57 
 
 		 541 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 541 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  64.38 
 
 		 540 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  70.32 
 
 		 541 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 543 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  69.75 
 
 		 541 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  65.75 
 
 		 537 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  71.04 
 
 		 540 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 541 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  64.38 
 
 		 543 aa  659    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  62.88 
 
 		 542 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 539 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 536 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  67.83 
 
 		 546 aa  677    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 540 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4924  chaperonin GroEL  70.13 
 
 		 541 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  63.62 
 
 		 547 aa  636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 541 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  69.19 
 
 		 540 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  63.76 
 
 		 540 aa  647    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  65.59 
 
 		 541 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  70.08 
 
 		 549 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  68.49 
 
 		 543 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 541 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  69.19 
 
 		 540 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.33 
 
 		 540 aa  643    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  67.34 
 
 		 536 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.31 
 
 		 544 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 544 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  67.16 
 
 		 537 aa  661    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  67.8 
 
 		 543 aa  686    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  68.22 
 
 		 536 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 540 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.34 
 
 		 546 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  69 
 
 		 545 aa  701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  67.04 
 
 		 535 aa  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.91 
 
 		 539 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  65.4 
 
 		 541 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  67.43 
 
 		 541 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  70.64 
 
 		 541 aa  732    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  65.09 
 
 		 542 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  63.87 
 
 		 541 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  63.58 
 
 		 545 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  68.4 
 
 		 536 aa  702    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  63.94 
 
 		 540 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 547 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  65.92 
 
 		 539 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  66.67 
 
 		 541 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  61.97 
 
 		 542 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  70.7 
 
 		 541 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  65.54 
 
 		 541 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 541 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  69.19 
 
 		 540 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  68.56 
 
 		 527 aa  699    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 541 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  69.75 
 
 		 544 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  64.57 
 
 		 545 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  64.64 
 
 		 540 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  64.83 
 
 		 540 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.42 
 
 		 538 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  65.84 
 
 		 539 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 550 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 541 aa  632  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  63.28 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 538 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  58.66 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  61.08 
 
 		 543 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  60.45 
 
 		 541 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  61.23 
 
 		 547 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  59.78 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  61.03 
 
 		 545 aa  623  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13451  chaperonin GroEL  65.47 
 
 		 539 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000682478  hitchhiker  0.00665427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  59.28 
 
 		 540 aa  618  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 541 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  59.54 
 
 		 548 aa  620  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  58.9 
 
 		 538 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  59.18 
 
 		 539 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  58.9 
 
 		 538 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  58.36 
 
 		 545 aa  613  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 541 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  57.95 
 
 		 576 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 541 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>