More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1846 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
544 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  67.99 
 
 
540 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
541 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  62.52 
 
 
548 aa  654    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
540 aa  647    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  76.05 
 
 
540 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0184  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
545 aa  644    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  67.6 
 
 
539 aa  709    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.27 
 
 
540 aa  639    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  64.96 
 
 
535 aa  660    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  64.64 
 
 
549 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  74.58 
 
 
541 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  65.71 
 
 
537 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  63.67 
 
 
547 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  64.45 
 
 
527 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.95 
 
 
536 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  73.57 
 
 
543 aa  772    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.17 
 
 
538 aa  663    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  74.34 
 
 
547 aa  756    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  74.22 
 
 
540 aa  769    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  75.14 
 
 
545 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
545 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.08 
 
 
539 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  73.06 
 
 
543 aa  775    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  71.89 
 
 
542 aa  748    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  65.1 
 
 
544 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  61.91 
 
 
555 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
544 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  65.48 
 
 
544 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  74.15 
 
 
546 aa  751    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  67.24 
 
 
544 aa  699    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
539 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  66.73 
 
 
536 aa  695    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  72.85 
 
 
542 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  61.1 
 
 
543 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
547 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.04 
 
 
546 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  72.02 
 
 
541 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  73.25 
 
 
540 aa  778    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  74.17 
 
 
540 aa  793    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  67.16 
 
 
542 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
542 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
544 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  65.68 
 
 
541 aa  707    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
543 aa  651    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
547 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
538 aa  672    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  67.17 
 
 
547 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  61.61 
 
 
541 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.18 
 
 
553 aa  643    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.94 
 
 
545 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  73.57 
 
 
541 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.1 
 
 
549 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  73.1 
 
 
541 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  67.67 
 
 
540 aa  707    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  75.86 
 
 
540 aa  791    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  63.31 
 
 
534 aa  643    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  65.67 
 
 
544 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
542 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  59.52 
 
 
539 aa  643    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
539 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  65.85 
 
 
544 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  75.86 
 
 
541 aa  764    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  61.51 
 
 
544 aa  636    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
538 aa  672    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  73.1 
 
 
541 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  74.3 
 
 
540 aa  760    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  65.46 
 
 
546 aa  688    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  73.45 
 
 
544 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.3 
 
 
539 aa  663    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
553 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
541 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  62.69 
 
 
538 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  74.71 
 
 
544 aa  764    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  61.76 
 
 
544 aa  639    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  73.38 
 
 
545 aa  751    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  64.2 
 
 
536 aa  648    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  73.1 
 
 
541 aa  756    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  67.11 
 
 
542 aa  690    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  100 
 
 
540 aa  1056    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
541 aa  697    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  61.39 
 
 
551 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
547 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  76.16 
 
 
539 aa  797    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  67.67 
 
 
541 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
538 aa  642    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
544 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  67.41 
 
 
538 aa  709    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  74.71 
 
 
542 aa  762    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
550 aa  670    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  67.11 
 
 
541 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  73.98 
 
 
541 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  73.1 
 
 
541 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  73.28 
 
 
541 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
547 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>