More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2941 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  65.72 
 
 
549 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  83.21 
 
 
540 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  66.92 
 
 
541 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  84.38 
 
 
541 aa  844    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  64.03 
 
 
542 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  77.82 
 
 
540 aa  821    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.5 
 
 
538 aa  674    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  90.43 
 
 
544 aa  925    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.08 
 
 
544 aa  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  656    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.71 
 
 
544 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  78.48 
 
 
541 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  66.47 
 
 
537 aa  683    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  85.19 
 
 
540 aa  899    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  656    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  78.85 
 
 
541 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  86.06 
 
 
542 aa  884    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
547 aa  648    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  62.15 
 
 
539 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  80.37 
 
 
540 aa  852    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  84.95 
 
 
542 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
540 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  64.94 
 
 
539 aa  675    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
550 aa  643    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  84.06 
 
 
541 aa  840    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.08 
 
 
544 aa  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  70.53 
 
 
544 aa  722    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  65.27 
 
 
527 aa  657    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  79.62 
 
 
541 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  78.78 
 
 
540 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  84.56 
 
 
544 aa  868    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  79.77 
 
 
545 aa  833    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  64 
 
 
536 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  100 
 
 
540 aa  1043    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  75.67 
 
 
541 aa  776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  78.78 
 
 
540 aa  835    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  82.32 
 
 
541 aa  856    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  82.99 
 
 
540 aa  851    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  64.03 
 
 
538 aa  648    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  82.14 
 
 
541 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  67.24 
 
 
542 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  82.58 
 
 
547 aa  836    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
540 aa  634    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.2 
 
 
545 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  63.75 
 
 
538 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  82.99 
 
 
542 aa  833    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
542 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  82.32 
 
 
541 aa  856    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  85.04 
 
 
546 aa  852    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  65.6 
 
 
540 aa  672    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
541 aa  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  70.93 
 
 
541 aa  726    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  62.52 
 
 
545 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  64.45 
 
 
535 aa  649    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  70.74 
 
 
541 aa  728    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  66.99 
 
 
540 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  80.37 
 
 
540 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  73.18 
 
 
540 aa  768    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
544 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  61.79 
 
 
541 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.95 
 
 
546 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  77.35 
 
 
542 aa  805    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
549 aa  634    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  90.06 
 
 
543 aa  942    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  78.6 
 
 
543 aa  820    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  84.5 
 
 
545 aa  865    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  64.26 
 
 
536 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  63.43 
 
 
536 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  80.74 
 
 
539 aa  845    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.5 
 
 
536 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  63.33 
 
 
541 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  79.34 
 
 
539 aa  834    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
541 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  656    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  80.19 
 
 
542 aa  834    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  81.37 
 
 
541 aa  855    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  65.33 
 
 
541 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  80.63 
 
 
541 aa  859    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  82.32 
 
 
541 aa  856    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  82.5 
 
 
541 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  64.12 
 
 
538 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  77.55 
 
 
541 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  78.56 
 
 
543 aa  823    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  87.62 
 
 
541 aa  896    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  63.1 
 
 
541 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  64 
 
 
546 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  62.4 
 
 
539 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  60.99 
 
 
545 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  60.79 
 
 
543 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
548 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  65.09 
 
 
546 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  58.55 
 
 
538 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
538 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
546 aa  624  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  59.15 
 
 
539 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
545 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.45 
 
 
547 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>