More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0002 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  67.83 
 
 
540 aa  735    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  70.6 
 
 
540 aa  747    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  71.64 
 
 
543 aa  767    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  58.68 
 
 
539 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  71.11 
 
 
540 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
544 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
544 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
541 aa  638    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  68.89 
 
 
541 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  60.54 
 
 
537 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  66.73 
 
 
540 aa  714    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
541 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
536 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  71.59 
 
 
542 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  68.94 
 
 
541 aa  703    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  72.85 
 
 
541 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  72.49 
 
 
541 aa  736    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  63 
 
 
527 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
544 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  64.33 
 
 
542 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  73.03 
 
 
546 aa  744    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.85 
 
 
538 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
536 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  61.31 
 
 
541 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
544 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
540 aa  648    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  70.54 
 
 
542 aa  721    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  65.66 
 
 
541 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  68.75 
 
 
540 aa  737    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
544 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  68.35 
 
 
543 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
544 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  58.81 
 
 
550 aa  645    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  72.23 
 
 
544 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  70.97 
 
 
547 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  68.87 
 
 
543 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  71.35 
 
 
540 aa  737    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  68.62 
 
 
545 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  71.72 
 
 
544 aa  751    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  69.83 
 
 
540 aa  735    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  73.22 
 
 
541 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  67.81 
 
 
542 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
540 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  100 
 
 
541 aa  1068    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  91.5 
 
 
541 aa  971    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  70.94 
 
 
541 aa  718    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
544 aa  686    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  72.18 
 
 
540 aa  748    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  69.24 
 
 
541 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  72.92 
 
 
541 aa  752    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  73.22 
 
 
541 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  69.5 
 
 
539 aa  744    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  71.43 
 
 
545 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  69.74 
 
 
542 aa  728    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  70.17 
 
 
540 aa  747    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  61.11 
 
 
539 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  68.51 
 
 
541 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  70.4 
 
 
539 aa  742    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  62.48 
 
 
541 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  60.86 
 
 
542 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
538 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  70.3 
 
 
541 aa  735    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
541 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  70.36 
 
 
541 aa  735    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  73.22 
 
 
541 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  70.6 
 
 
542 aa  741    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  72.66 
 
 
541 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  60.71 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  69.64 
 
 
540 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
536 aa  628  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  57.84 
 
 
538 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  57.84 
 
 
538 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  58.37 
 
 
546 aa  628  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
540 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  59.47 
 
 
538 aa  625  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  59.26 
 
 
541 aa  625  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  59.07 
 
 
538 aa  628  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
547 aa  626  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
541 aa  626  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
536 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  59.07 
 
 
538 aa  628  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
535 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
547 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  59.13 
 
 
544 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  60 
 
 
545 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0184  chaperonin GroEL  58.44 
 
 
545 aa  620  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  58.18 
 
 
539 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  58.77 
 
 
542 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  56.75 
 
 
539 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  58.5 
 
 
542 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  59.51 
 
 
538 aa  611  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  58.52 
 
 
540 aa  608  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  57.49 
 
 
553 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  57.83 
 
 
545 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  58.47 
 
 
542 aa  608  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  59.39 
 
 
545 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  58.53 
 
 
543 aa  609  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  57.5 
 
 
544 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>