More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13451 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  73.1 
 
 
537 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  65.09 
 
 
546 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13451  chaperonin GroEL  100 
 
 
539 aa  1052    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000682478  hitchhiker  0.00665427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
541 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  61.22 
 
 
537 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  82.26 
 
 
540 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  70.23 
 
 
541 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  62.67 
 
 
541 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4924  chaperonin GroEL  81.7 
 
 
541 aa  788    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  63.84 
 
 
540 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  64.33 
 
 
541 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  82.26 
 
 
540 aa  844    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  67.65 
 
 
537 aa  708    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1208  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
543 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.730524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
536 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
536 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  61.37 
 
 
536 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  66.23 
 
 
534 aa  685    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  63.52 
 
 
541 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  82.26 
 
 
540 aa  844    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  81.13 
 
 
544 aa  821    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  59.63 
 
 
535 aa  628  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  63.17 
 
 
527 aa  628  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  61.71 
 
 
541 aa  628  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
541 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
540 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
540 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
540 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  61.35 
 
 
540 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
542 aa  622  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
540 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
544 aa  623  1e-177  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  62.12 
 
 
541 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
545 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
541 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
542 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
542 aa  618  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  59 
 
 
538 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
541 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
541 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
544 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.93 
 
 
541 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  61.63 
 
 
543 aa  618  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
540 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
540 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
545 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  62.88 
 
 
541 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
540 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  61.17 
 
 
547 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
540 aa  614  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
539 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  60.95 
 
 
545 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  60.46 
 
 
539 aa  611  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  60.68 
 
 
544 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
542 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
549 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
546 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
541 aa  605  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  59.58 
 
 
541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  58.19 
 
 
543 aa  598  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
546 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  59.77 
 
 
541 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  58.41 
 
 
539 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  60.34 
 
 
542 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  58.56 
 
 
540 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  57.28 
 
 
541 aa  594  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  57.79 
 
 
541 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  57.69 
 
 
541 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  58.44 
 
 
542 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  55.95 
 
 
546 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  57.38 
 
 
547 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  57.87 
 
 
543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  58.16 
 
 
540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  56.55 
 
 
541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  57.01 
 
 
541 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  56.36 
 
 
544 aa  581  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  57.12 
 
 
538 aa  579  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  56.76 
 
 
536 aa  577  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  56.79 
 
 
547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  56.52 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  57.89 
 
 
541 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  57.31 
 
 
540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  55.24 
 
 
543 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  55.77 
 
 
550 aa  569  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  54.78 
 
 
538 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  56 
 
 
539 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  53.57 
 
 
538 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  53.57 
 
 
538 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  56 
 
 
545 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  53.33 
 
 
543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  54.51 
 
 
541 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  57.22 
 
 
541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  55.2 
 
 
539 aa  558  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  53.99 
 
 
544 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  55.03 
 
 
544 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  53.61 
 
 
538 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  55.22 
 
 
544 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>