More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1087 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 540 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1008  chaperonin GroEL  67.17 
 
 		 540 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.208595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  63.81 
 
 		 540 aa  665    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6543  chaperonin GroEL  65.33 
 
 		 541 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.14292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8122  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 541 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1155  chaperonin GroEL  65.78 
 
 		 541 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4257  chaperonin GroEL  66.8 
 
 		 540 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  60.78 
 
 		 541 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2598  chaperonin GroEL  67.04 
 
 		 537 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  62.55 
 
 		 541 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 540 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  62.52 
 
 		 539 aa  650    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6001  chaperonin GroEL  66.67 
 
 		 549 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  63.95 
 
 		 542 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4452  chaperonin GroEL  67.43 
 
 		 546 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 538 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0736  chaperonin GroEL  68.38 
 
 		 542 aa  690    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105479  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1087  chaperonin GroEL  100 
 
 		 541 aa  1072    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0894  chaperonin GroEL  63.19 
 
 		 544 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 536 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  63.74 
 
 		 545 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  60.87 
 
 		 543 aa  639    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0633  chaperonin GroEL  66.61 
 
 		 546 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 540 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  63.92 
 
 		 542 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.86 
 
 		 540 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 541 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16540  chaperonin GroEL  64.94 
 
 		 535 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.634552  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07570  chaperonin GroL  65.06 
 
 		 538 aa  680    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130113  normal  0.481128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04670  chaperonin GroL  63.36 
 
 		 534 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0132955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 540 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  64.08 
 
 		 544 aa  674    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  61.5 
 
 		 541 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  62 
 
 		 540 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3636  chaperonin GroEL  63.88 
 
 		 542 aa  659    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 540 aa  640    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  61.11 
 
 		 540 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  61.42 
 
 		 543 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  67.6 
 
 		 536 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  60.69 
 
 		 546 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 547 aa  635    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.83 
 
 		 538 aa  645    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0779  chaperonin GroEL  63.38 
 
 		 545 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2886  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 536 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00686344  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  64.14 
 
 		 539 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  65.08 
 
 		 541 aa  673    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07610  chaperonin GroL  63.19 
 
 		 547 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0620  chaperonin GroEL  66.03 
 
 		 541 aa  692    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649216  normal  0.27477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08640  chaperonin GroL  65.14 
 
 		 527 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  68.38 
 
 		 541 aa  704    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 541 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  61.5 
 
 		 541 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  62.24 
 
 		 541 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4231  chaperonin GroEL  72.05 
 
 		 545 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732523  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0821  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 542 aa  648    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.397191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0784  chaperonin GroEL  63 
 
 		 542 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  61.5 
 
 		 541 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0689  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 541 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00401944  hitchhiker  0.000000708621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 542 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  61.68 
 
 		 541 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2594  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 536 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000567378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  63.62 
 
 		 540 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3841  chaperonin GroEL  72.05 
 
 		 543 aa  713    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 541 aa  632  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1154  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1171  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.320819 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0717  chaperonin GroL  60.81 
 
 		 541 aa  633  1e-180  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.514239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1181  chaperonin GroEL  63.52 
 
 		 540 aa  633  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0347435 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  58.16 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  58.16 
 
 		 538 aa  630  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1495  chaperonin GroEL  63.21 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  60.54 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04090  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0899  chaperonin GroEL  60.63 
 
 		 537 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31590  chaperonin GroL  60.83 
 
 		 544 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2055  chaperonin GroEL  59.93 
 
 		 543 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00350508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  60.8 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  60.69 
 
 		 538 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2941  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 540 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2175  chaperonin GroEL  59.89 
 
 		 541 aa  624  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.755929  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5812  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34390  chaperonin GroEL  61.14 
 
 		 541 aa  621  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.950181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  59.7 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4506  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 541 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030252  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0002  chaperonin GroEL  59.33 
 
 		 541 aa  618  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0309726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4827  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 541 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  59.54 
 
 		 539 aa  615  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  58.67 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  60.49 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1720  chaperonin GroEL  61.82 
 
 		 537 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  57.93 
 
 		 543 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  59 
 
 		 539 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  57.9 
 
 		 541 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 544 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  58.96 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  57.71 
 
 		 543 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  57.79 
 
 		 539 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>