More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06180 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  100 
 
 
469 aa  964    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  44.62 
 
 
445 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  44.14 
 
 
444 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  44.95 
 
 
444 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  44.72 
 
 
444 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  44.72 
 
 
444 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  44.04 
 
 
444 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  44.27 
 
 
444 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  44.04 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  43.81 
 
 
442 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  43.58 
 
 
442 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  43.81 
 
 
448 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  44.8 
 
 
451 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  45.14 
 
 
441 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  42.76 
 
 
443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  41.69 
 
 
440 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  43.89 
 
 
451 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  41.88 
 
 
448 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  44.44 
 
 
441 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  42.99 
 
 
450 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.86 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  40.98 
 
 
446 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  43.81 
 
 
441 aa  316  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  40.52 
 
 
443 aa  316  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  39.91 
 
 
447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  40.93 
 
 
442 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  40.58 
 
 
447 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  41.36 
 
 
446 aa  309  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  41.45 
 
 
447 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  40.41 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  40.52 
 
 
461 aa  300  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  40.51 
 
 
442 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  39.01 
 
 
447 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  39.32 
 
 
444 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  38.93 
 
 
444 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  39.81 
 
 
442 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  39.58 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  33.41 
 
 
455 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  34.02 
 
 
459 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  35.43 
 
 
444 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  34.18 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  36.71 
 
 
465 aa  239  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  34.33 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  34.33 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  34.33 
 
 
436 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  33.95 
 
 
436 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.57 
 
 
451 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  33.41 
 
 
464 aa  226  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  33.56 
 
 
466 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.05 
 
 
467 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  34.01 
 
 
451 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  33.64 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  33.41 
 
 
470 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  31.52 
 
 
458 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  34.72 
 
 
451 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  33.57 
 
 
470 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  33.41 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  32.54 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  33.41 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  35.57 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  33.18 
 
 
465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  33.94 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  30.82 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  31.03 
 
 
471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  34.03 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  32.2 
 
 
473 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0847  hypothetical protein  32.2 
 
 
473 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  32.2 
 
 
473 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34 
 
 
450 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  29.84 
 
 
456 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0161  hypothetical protein  31.08 
 
 
463 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  34 
 
 
450 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  29.84 
 
 
456 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  33.72 
 
 
452 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  31.24 
 
 
451 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  30.5 
 
 
472 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  29.95 
 
 
453 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  32.86 
 
 
460 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  31.52 
 
 
473 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  31.38 
 
 
469 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  30 
 
 
453 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  31.42 
 
 
459 aa  209  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  33.64 
 
 
463 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  34.32 
 
 
467 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  30.21 
 
 
453 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  30.05 
 
 
466 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  29.49 
 
 
453 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>