287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01900 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02308  ClC chloride ion channel (Eurofung)  48.81 
 
 		 828 aa  742    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.382711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01900  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00397821  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53364  voltage-gated chloride channel  42.13 
 
 		 764 aa  604  1.0000000000000001e-171  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06311  ClC chloride ion channel (Eurofung)  33.04 
 
 		 793 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06107  CLC channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870M6]  30.44 
 
 		 909 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.20732  normal  0.131172 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03790  voltage-gated chloride channel, putative  36.67 
 
 		 897 aa  351  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57787  voltage-gated protein/chloride channel  27.69 
 
 		 869 aa  300  8e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0658005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83582  chloride channel, possibly voltage gated  30.52 
 
 		 818 aa  261  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50496  ClC family transporter: chloride ion channel  26.42 
 
 		 869 aa  213  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.913408  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_52412  channel voltage activated chloride channel  27.68 
 
 		 693 aa  212  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28245  voltage activated chloride channel CLC7 type  26.15 
 
 		 768 aa  211  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.385606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.86 
 
 		 859 aa  162  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  23.48 
 
 		 863 aa  150  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46097  predicted protein  27.15 
 
 		 980 aa  136  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  25.37 
 
 		 863 aa  135  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  24.38 
 
 		 862 aa  131  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14344  ClC family transporter: chloride ion channel  24.91 
 
 		 718 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  25.86 
 
 		 875 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.02 
 
 		 897 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34455  ClC family transporter: chloride ion channel  23.2 
 
 		 802 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  24.7 
 
 		 534 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.71 
 
 		 510 aa  110  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  25.36 
 
 		 879 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  25.36 
 
 		 879 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  26.44 
 
 		 519 aa  108  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  26.67 
 
 		 519 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  26.43 
 
 		 471 aa  105  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  23.8 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  24.77 
 
 		 456 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.6 
 
 		 526 aa  98.2  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  26.03 
 
 		 473 aa  97.4  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  24.4 
 
 		 512 aa  97.4  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  26.03 
 
 		 473 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  26.03 
 
 		 473 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  26.03 
 
 		 473 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  26.03 
 
 		 473 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  25.25 
 
 		 569 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  23.99 
 
 		 614 aa  95.5  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  24.86 
 
 		 613 aa  94.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  22.2 
 
 		 538 aa  93.2  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  23.79 
 
 		 463 aa  92.8  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  22.89 
 
 		 479 aa  92.8  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  25.12 
 
 		 466 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.87 
 
 		 436 aa  91.3  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  24.43 
 
 		 533 aa  90.9  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  25.06 
 
 		 510 aa  90.1  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  24.76 
 
 		 470 aa  89.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  24.15 
 
 		 669 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  23.42 
 
 		 528 aa  88.2  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.88 
 
 		 439 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  27.88 
 
 		 439 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.88 
 
 		 439 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  26.61 
 
 		 631 aa  87.8  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  26.3 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  25.64 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  23.75 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  23.75 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  23.75 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  25.28 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  23.04 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  24.94 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  26.54 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  25.59 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  23.65 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.13 
 
 		 582 aa  80.5  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  22.82 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  24.94 
 
 		 627 aa  79.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  26.58 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  20.88 
 
 		 612 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.11 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  23.33 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.94 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  23.08 
 
 		 539 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  25.76 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  23.67 
 
 		 597 aa  76.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  24.43 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  23.54 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  21.5 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18921  putative chloride channel  23.43 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  23.82 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.36 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  23.64 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  22.65 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.2 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  27.59 
 
 		 427 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.09 
 
 		 636 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.7 
 
 		 587 aa  73.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  23.17 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  24.6 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.14 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  21.69 
 
 		 598 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.14 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.14 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19111  putative chloride channel  23.43 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.52 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.52 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18921  putative chloride channel  22.93 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.708029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.73 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  24.46 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.52 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>